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基因工程的基本技术主要内容基因工程的基本技术之一一、核酸提取技术1、植物组织中基因组DNA的提取(3)、引物延伸温度与时间:2)线状DNA的浓缩与纯化(P31-33)pH值:偏碱性,带负电荷4)、反应缓冲液成分:吸收峰:DNA紫外光260nm体系成分:模板DNA、引物、Taq酶(热稳定性)、dNTP、反应缓冲液(Mg2+、BSA、Tween20、DTT、Tris.基因工程的基本技术之一§、溶液Ⅰ:50mol/L葡萄糖,25mmol/LTris-Cl离子浓度:离子浓度高电流大2、幼嫩组织DNA的得率高还是低?对纯度要求不高,但含有酚、氯仿等杂质则难以成功。4、电泳:接通电源,调好电压荧光域值(threshold)的设定4)、反应缓冲液成分:3、反转电场电泳(FIGE)060-400再思考:1、研磨破碎组织必须在低温下进行。------为什么?ⅱ提取DNA的质量鉴定:DNA的相对完整性:凝胶电泳DNA的纯度:测OD值2、质粒DNA的提取ⅰ质粒DNA提取方法:抽提质粒DNA所需的溶液:实验步骤7、加等量的氯仿/异戊醇(V:V=24:1)抽提,离心;8、移取上清液,加入2倍体积无水乙醇,混匀,-20℃静置5min,离心,弃上清;9、用70%乙醇洗DNA沉淀2次,离心,倒掉乙醇,吹干;10、用TE(pH8.0,)溶解质粒DNA,并加入RnaseA达浓度为10μg/ml,37℃放置1小时11、取1μL质粒DNA用于电泳检测。ⅲ抽提出质粒的构型:抽提出的质粒三种构型电泳结果:0),10mmol/LEDTA(pH8.primer1(10M)现配现用;2、把菌液放入Ep管中,离心,弃上清;OD260/280<1.在碱性条件下,双连DNA氢键断裂,结构破坏变性,环状超螺旋质粒不充分变性。9%0.Endingreaction6%1-20590-500抽提出的质粒三种构型电泳结果:利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。低熔点琼脂糖:用于DNA的回收(65℃)二、凝胶电泳技术琼脂糖凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳(一)、影响电泳迁移率的因素操作简单;分辨范围:100bp-60kb;有效范围:200bp-50kb;分辨率:100bp左右常用于微卫星、测序分析;分辨范围:5-500bp;分辨率:1bp♦凝胶分辨DNA的能力:4、电泳缓冲液电泳缓冲液的选择(二)、电泳指示剂和DNA染色剂DNA染色剂(三)凝胶电泳过程1、单向电泳中文名称:聚合酶链式反应PCR操作流程2、PCR反应过程:3、PCR反应体系:1)、引物(寡聚核苷酸)2)、模板DNA:§基因组DNA、质粒DNA、其它DNA片段;§质量要求:不高3)、Taq酶(热稳定性):§常规酶§高保真酶:ExTaq§LaTaq酶4)、反应缓冲液成分:§BSA、Tween20、DTT、明胶----保护酶作用§Tris.cl提供缓冲作用§(2)、dNTP的浓度:常用100-200µmol/L,不能低于20µmol/L,特异性、保真性;§(3)、模板:主要考虑纯度及使用量对纯度要求不高,但含有酚、氯仿等杂质则难以成功。使用量从几个ng到100ng.以普通PCR50lreactionsolution为例)§PCRthermalprogram6、PCR的种类F(3)反向PCR:根据已知序列扩增两侧序列的方法。(4)定量PCR实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。原理:通过实时检测PCR每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量及定性的分析。初始模板量X0的对数值与C(T)值之间呈线性关系:logX0=-log(1+Ex)*Ct+logNPCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号,荧光域值的缺省设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍,即:threshold=10´SDcycle6-15研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,其中横坐标代表起始拷贝数的对数,纵坐标代Ct值。因此,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。荧光信号如何产生?思考题1感谢观看