数字病理切片的辅助标注方法、系统和可读存储介质.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN113870277A(43)申请公布日2021.12.31(21)申请号202110952991.3G06N3/04(2006.01)(22)申请日2021.08.19G06F16/53(2019.01)(71)申请人杭州迪英加科技有限公司地址311121浙江省杭州市余杭区仓前街道龙潭路7号未来研创园B座5楼B501-B508室(72)发明人徐小川杨林(74)专利代理机构杭州华知专利事务所(普通合伙)33235代理人束晓前(51)Int.Cl.G06T7/11(2017.01)G06T7/90(2017.01)G06T5/00(2006.01)G06N3/08(2006.01)权利要求书2页说明书10页附图1页(54)发明名称数字病理切片的辅助标注方法、系统和可读存储介质(57)摘要本发明公开的一种数字病理切片的辅助标注方法、系统和可读存储介质，其中方法包括：获取接收到的数字化文件，得到所述数字病理切片；将所述数字病理切片输入到诊断神经网络模型中，得到模拟输出值，获取未标注信息的切片作为目标切片；识别所述目标切片的切片轮廓信息，进行初始标注；将经过初始标注后的所述数字病理切片按照类型进行分组，并标记不同颜色予以区分后发送给用户端。本发明通过获取并识别数字病理切片，可以对切片内的信息进行辅助标注，设置两种标注方式，除利用CNN神经网络标注外，还通过对切片的轮廓信息进行识别标注，同时对标注的信息进行分组分级，有助于用户端使用时可以更加清晰明了，提高标注准确率与标注效率。CN113870277ACN113870277A权利要求书1/2页1.一种数字病理切片的辅助标注方法，其特征在于，包括以下步骤：获取接收到的数字化文件，从中识别出数字病理图像，经过预处理以得到所述数字病理切片，并将切片状态标记为第一状态；将所述数字病理切片输入到训练好的诊断神经网络模型中，得到模拟输出值，基于所述模拟输出值获取未标注信息的切片作为目标切片；识别所述目标切片的切片轮廓信息，调取预存的标注数据库进行匹配识别所述轮廓信息，进行初始标注；将经过初始标注后的所述数字病理切片按照类型进行分组，并标记不同颜色予以区分后发送给用户端，并将所述切片状态标记为第二状态。2.根据权利要求1所述的一种数字病理切片的辅助标注方法，其特征在于，所述获取接收到的数字化文件，从中识别出数字病理图像，经过预处理以得到所述数字病理切片，并将切片状态标记为第一状态，具体为：识别目标格式以从所述数字化文件中得到所述数字病理图像；对所述数字病理图像进行图像预处理得到所述数字病理切片；标记所述数字病理切片的属性栏中的所述切片状态为第一状态。3.根据权利要求1所述的一种数字病理切片的辅助标注方法，其特征在于，所述诊断神经网络模型训练方法为：收集目标图像信息和标识信息；对目标图像信息进行特征提取，得到特征区域图像；将得到特征区域图像，进行自动化筛选，去除质量差的图像；将筛选后的图像进行多分辨率的变化处理，得到多个分辨率的图像，然后随机选择一个分辨率的图像，进行模糊处理，再进行光滑处理；将经过光滑处理之后的图像还原回原始分辨率的大小，得到诊断神经网络模型的输入，进行诊断神经网络的训练。4.根据权利要求1所述的一种数字病理切片的辅助标注方法，其特征在于，所述识别所述目标切片的切片轮廓信息，调取预存的标注数据库进行匹配识别所述轮廓信息，进行初始标注，具体为：获取所述模拟输出值的数据，识别标注数据以及未标注数据，其中，所述标注数据是基于预设的辅助诊断算法对所述病理切片进行标注的；提取所述未标注数据，识别所述切片轮廓信息，利用所述标注数据库中的单点、矩形线框以及不规则闭合线框对所述轮廓信息进行匹配，其中，所述矩形线框的优先级高于所述不规则闭合线框，所述不规则闭合线框的优先级高于所述单点。5.根据权利要求4所述的一种数字病理切片的辅助标注方法，其特征在于，所述将经过初始标注后的所述数字病理切片按照类型进行分组，并标记不同颜色予以区分后发送给用户端，具体为：设置若干种颜色对所述数字病理切片的类型进行区分，其中，设置的若干种所述颜色两两为互补色；识别所述标注数据以及所述匹配标记的单点、矩形线框以及不规则闭合线框，利用所2CN113870277A权利要求书2/2页述颜色进行标记；将通过颜色标记后的所述数字病理切片发送给所述用户端。6.根据权利要求1所述的一种数字病理切片的辅助标注方法，其特征在于，还包括对所述目标切片分级，具体为：识别所述标注数据库的匹配结果；提取所述匹配结果的匹配数量值，基于所述匹配数量值判断与预设阈值的大小，其中，若所述匹配数量值小于所述预设阈值，则将所述目标切片的等级设置为I级；若所述匹配数量值大于或者等于所述预设阈