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本实用新型提供了一种外泌体分离系统,包括1)第一死端过滤装置,用于从包括所述外泌体的细胞培养上清液中除去粒径大于所述外泌体的粒径的细胞组分;2)与所述第一死端过滤装置连接的第一容器,其容纳经所述死端过滤装置过滤后的滤出液;以及3)切向流过滤装置,用于对所述第一容器中的所述滤出液进行循环浓缩,同时除去粒径小于所述外泌体的粒径的细胞组分。本实用新型外泌体分离系统可用于外泌体大规模分离,解决了现有技术中外泌体分离操作复杂、样本量小、重复性差的问题。