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(19)中华人民共和国国家知识产权局*CN102181532A*(12)发明专利申请(10)申请公布号CN102181532A(43)申请公布日2011.09.14(21)申请号201110067025.X(22)申请日2011.03.21(71)申请人中国科学院武汉病毒研究所地址430071湖北省武汉市武昌区小洪山中区44号(72)发明人王华林尹飞飞邓菲胡志红袁勤芬(74)专利代理机构湖北武汉永嘉专利代理有限公司42102代理人王守仁(51)Int.Cl.C12Q1/68(2006.01)权利要求书3页说明书21页(54)发明名称用液相芯片检测虫媒或接触传播病原的引物和探针及方法(57)摘要本发明是用液相芯片检测虫媒或接触传播病原的引物和探针及方法,其用于9种临床常见的虫媒或接触传播的传染病病原的检测。本发明基于MASA液相芯片技术对9种临床常见的虫媒或接触传播的传染病病原进行检测,主要根据基因库中能够检索到的9种目标病毒所有的核苷酸序列分别进行同源性分析,设计简并引物和特异性探针,通过两轮PCR,分子杂交,再用Luminex100系统检测,确定样本中所含病原体的种类。本发明提供的对这9种临床常见的虫媒或接触传播的传染病病原的检测及早期诊断,对于采取正确的治疗方案和及时的应对措施以防止疾病的传播至关重要。本发明具有检测速度快、操作简单、敏感性高、特异性好和利于推广应用等优点。CN102853ACCNN110218153202181535A权利要求书1/3页1.一种用液相芯片检测虫媒或接触传播病原的引物,其特征是一种基于MASA液相芯片对临床常见的虫媒或接触传播的传染病病原进行检测的引物,该引物是根据基因库中能够检索到的目标病毒所有的核苷酸序列分别进行同源性分析和设计的,具体是:(1)用于检测乙型脑炎病毒的引物F、引物R的DNA序列:JEV-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGCCGAGAGAATTCAGGAGGTGJEV-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCGCGAGCATGCGGTGTTCAC(2)用于检测登格热病毒I型的引物F、引物R的DNA序列:DEN1-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGCGTGCAATATGGTACATGTGGDEN1-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCTCATTCTGAAGATCATCCTCTG(3)用于检测登格热病毒II型的引物F、引物R的DNA序列:DEN2-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGTCGGCACGTGAGGCTGTTGDEN2-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCCCACTCCGCTCAGAGAGTTC(4)用于检测登格热病毒III型的引物F、引物R的DNA序列:DEN3-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGGGCAGTAGAGCTATATGGTACDEN3-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCGTGTCCCAACCAGCTGTGTC(5)用于检测登格热病毒IV型的引物F、引物R的DNA序列:DEN4-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGGTTAGGAGAGTTTGGCAGAGCDEN4-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCTTCTTGTCTATCTCCTCCAGG(6)用于检测肠道病毒EV71的引物F、引物R的DNA序列:EV71-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGGCAGCCCAAAAGAACTTCACEV71-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCAACACAGCGTGTCTCAATCAT(7)用于检测腺病毒的引物F、引物R的DNA序列:ADV-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGARTGGKCDTACATGCACATCADV-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCCGRTCBGTGGTCACRTCGTG(8)用于检测单纯疱疹病毒I型和II型的引物F、引物R的DNA序列相同,序列为:HerpesVirus-F:CTGGTCCGTACTTCCGAGCGGCTCGAGTGCGAAAAAACGTTCHerpesVirus-R:TACAGTCGGTCGCGTGCCTCTGCGGTTGATAAACGCGCAGT。2.一种用液相芯片检测虫媒或接触传播病原的探针,其特征是有9种探针,它们分别与权利要求1所述的8种引物对应设计,所述探针的DNA序列为:(1)用于检测乙型脑炎病毒的JEV-probe探针的DNA序列:NH2-(CH2)12CCAGCTATGTCACGGAGGAT(2)用于检测登格热病毒I型的DEN1-probe探针的DNA序列:NH2-(CH2)12GGAATCTTTGATATGTCTCTGA(3)用于检测登格热病毒II型的DEN2-probe探针的DNA序列:N