用液相芯片检测呼吸道传染病病原的引物和探针及方法.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局*CN102181576A*(12)发明专利申请(10)申请公布号CN102181576A(43)申请公布日2011.09.14(21)申请号201110067021.1(22)申请日2011.03.21(71)申请人中国科学院武汉病毒研究所地址430071湖北省武汉市武昌区小洪山中区44号(72)发明人王华林尹飞飞邓菲胡志红(74)专利代理机构湖北武汉永嘉专利代理有限公司42102代理人王守仁(51)Int.Cl.C12Q1/70(2006.01)C12Q1/68(2006.01)C12N15/11(2006.01)G01N21/64(2006.01)权利要求书3页说明书20页(54)发明名称用液相芯片检测呼吸道传染病病原的引物和探针及方法(57)摘要本发明公开了用液相芯片检测呼吸道传染病病原的引物和探针及方法，其用于9种临床常见呼吸道传染病病原的检测。本发明基于MASA液相芯片技术对9种临床常见呼吸道传染病病原进行检测，主要根据基因库中能够检索到的9种目标病毒所有的核苷酸序列分别进行同源性分析，设计简并引物和特异性探针，通过两轮PCR，分子杂交，再用Luminex100系统进行检测，从而确定样本中所含病原体的种类。本发明提供的对这9种临床常见呼吸道传染病病原的检测及早期诊断，其对于采取正确的治疗方案和及时的应对措施以防止疾病的传播至关重要。本发明具有检测速度快、操作简单、敏感性高、特异性好等优点，适合大范围的推广应用。CN1028576ACCNN110218157602181579A权利要求书1/3页1.一种用液相芯片检测呼吸道传染病病原的引物，其特征是一种基于MASA液相芯片对临床常见呼吸道传染病病原进行检测的引物，该引物根据基因库中能够检索到的目标病毒所有的核苷酸序列分别进行同源性分析和设计，具体是：（1）用于检测人呼吸道合胞体病毒A型的引物F、引物R的DNA序列：HRSVA-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGCAGCTTATCAAATGGAGTTAGTGHRSVA-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCTCATTTGTTATAGGCATATCATTG（2）用于检测人呼吸道合胞体病毒B型的引物F、引物R的DNA序列：HRSVB-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGAGGTGTAGGATCTGCAATAGCHRSVB-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCCAATGTTGGAGATGCGACAGC（3）用于检测流感病毒A型的引物F、引物R的DNA序列：InfVA-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGACAGCATCGGTCTCACAGACInfVA-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCCTTGAATCGCTGCATCTGCAC（4）用于检测流感病毒B型的引物F、引物R的DNA序列：InfVB-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGTGTGAGCTTTCATGAAGCATTTGInfVB-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCTTCATAGCTGAGACCATCTGC（5）用于检测SARS的引物F、引物R的DNA序列：SARS-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGTACACACCTCAGCGTTGSARS-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCCACGAACGTGACGAAT（6）用于检测副流感病毒I型的引物F、引物R的DNA序列：PIV-1-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGTGAGTGATTAAGTTTGATGAPIV-1-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCATTATTACCYGGACCAAG（7）用于检测副流感病毒II型的引物F、引物R的DNA序列：PIV-2-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGCCTAAGTGATGGAATCAATCGCPIV-2-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCAAGCCTAGATGATAGATCCCGC（8）用于检测副流感病毒III型的引物F、引物R的DNA序列：PIV-3-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGATGCTTATACCTCRAATCTAPIV-3-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCTRGGATTTAAGTCAGGTACC（9）用于检测腮腺炎病毒的引物F、引物R的DNA序列：Mumpsvirus-F：CTGGTCCGTACTTCCGAGCGATTAGATTAGCAGATAGATCACCMumpsvirus-R：TACAGTCGGTCGCGTGCCTCGATTAGTACACTGTAGCATCG。2.一种用液相芯片检测呼吸道传染病病原的探针，其特征是有9种探针，它们分别与权利要求1所述的9种引物对应制成，所述探针的DNA序