人参叶和根cDNA文库构建及表达序列标签分析的任务书.docx

人参叶和根cDNA文库构建及表达序列标签分析的任务书
任务书
任务名称：人参叶和根cDNA文库构建及表达序列标签分析
任务描述：
本任务旨在构建人参叶和根的cDNA文库，并通过表达序列标签分析（EST）来鉴定和描述这两种植物的转录组。任务包括以下步骤：
1.提取人参叶和根的总RNA并进行纯化。
2.利用SMART技术将RNA转录为cDNA，构建叶和根的cDNA文库。
3.进行质控评估，如测序质量、插入大小和方向等。
4.利用高通量测序技术对两个文库进行测序，并得到原始序列数据。
5.对原始序列数据进行过滤和拼接，得到连续的EST序列。
6.对EST序列进行注释和比对分析，鉴定和描述参与转录和调控的基因和转录因子。
7.根据EST序列的定量分析，计算基因表达水平及分布，进而研究这两种植物的转录组差异。
8.根据分析结果，研究人参的代谢途径及关键代谢酶基因，为后续人参功能基因组学研究提供基础数据。
任务收获：
1.获得人参叶和根的cDNA文库，并得到连续的EST序列，有助于描述和鉴定人参的转录组和代谢途径。
2.通过表达序列标签分析，获得基因表达的定量数据和分布规律，有助于研究植物转录组的调控和差异表达。
3.发现并鉴定与人参代谢和生长调控相关的基因和转录因子，为进一步研究人参功能基因组提供基础数据支持。
主要参与人员：
1.实验室负责人：负责任务的设计、指导和评估。
2.实验员：负责任务的实施、数据质量控制和分析。
3.生物信息学分析师：负责整合分析生物信息学数据，包括序列比对、注释和表达模式分析等。
4.统计学专家：负责基因表达数据的定量和分布统计分析。
任务时间：
本任务周期为12个月。其中，取样和预处理阶段约需1个月，文库构建和质控评估阶段约需2个月，高通量测序阶段约需3个月，EST序列分析和基因表达分析阶段约需6个月。