草鱼肝肾cDNA文库构建及部分功能基因的序列分析的任务书.docx

草鱼肝肾cDNA文库构建及部分功能基因的序列分析的任务书
任务书：
1.任务背景
草鱼是一种广泛分布于我国南北各地的常见淡水鱼类，其肉质鲜美，营养丰富，广受消费者喜爱。然而，随着水质污染和环境变化等因素的影响，草鱼的养殖质量和数量逐渐受到限制。因此，对草鱼的生物学研究显得尤为重要。
肝脏和肾脏是动物体内重要的代谢和排泄器官，对于保证生物体内环境的稳定至关重要。在草鱼肝肾中含有众多的代谢和排泄相关基因，其中一些基因可能参与草鱼的免疫防御、营养代谢、生殖发育等多种生理功能。
因此，构建草鱼肝肾cDNA文库并对其进行序列分析，探索和研究这些重要基因，对于深入了解草鱼的生理功能具有重要意义。
2.任务目的
本任务旨在：
（1）构建草鱼肝肾cDNA文库；
（2）对文库中的部分功能基因进行序列分析，包括基因注释、编码蛋白质预测、结构域分析等。
3.任务内容
（1）草鱼肝肾组织的采集和总RNA的提取：采用RNAzol®RT试剂，从草鱼肝肾组织中提取总RNA，并使用琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性和浓度。
（2）cDNA文库构建：利用SMARTer™PCRcDNA合成试剂盒，构建草鱼肝肾cDNA文库。
（3）文库的筛选：利用筛选方法，对构建好的文库进行质量检测，筛选出合适的克隆片段进行序列分析。
（4）序列分析：对筛选出的部分功能基因进行序列分析，包括基因注释、编码蛋白质预测、结构域分析等，进一步探索和研究这些基因的生理功能。
4.任务时间和地点
本任务计划于2022年5月至2023年4月在XX大学生物学实验室完成，任务地点为XX大学。
5.任务经费
本任务经费共计10万元，主要用于实验耗材和设备购置、人员培训等方面。其中，实验耗材费用为6万元，设备购置费用为3万元，人员培训费用为1万元。
6.任务成果与要求
（1）完成草鱼肝肾cDNA文库的构建；
（2）筛选出2~3个功能基因片段进行序列分析，提交相应的注释、蛋白质预测和结构域分析结果；
（3）撰写对应的研究报告，并完成中英文摘要和关键词；
（4）完成文献综述和数据处理，并提交相应的文献清单和数据表格。
7.参考文献
1.ChenJ,etal.ConstructionofanormalizedcDNAlibrarybysuppressionsubtractivehybridizationofdormantandactivebudsinCinnamomumcamphora.Planta.2016,243(1):211-22.
2.Chun-meiW,etal.Construction,characterization,andcomparisonofthreenormalizationlibrariesforeDNAandeRNAsequencingfromfivefreshwaterhabitattypes.EnvironSciPollutRes.2019,26(19):19426–19437.
3.WangY,etal.Cloning,sequencingandmRNAexpressionofvitellogenininhalf-smoothtonguesole(Cynoglossussemilaevis).Aquaculture.2013,388-391:41-47.