大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1及其应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN105671039A(43)申请公布日2016.06.15(21)申请号201610129122.X(22)申请日2016.03.07(71)申请人南京农业大学地址210095江苏省南京市玄武区卫岗1号(72)发明人赵团结曹永策盖钧镒李曙光孔杰杰杨成凤(74)专利代理机构南京知识律师事务所32207代理人高玲玲(51)Int.Cl.C12N15/11(2006.01)C12Q1/68(2006.01)权利要求书1页说明书5页序列表1页附图2页(54)发明名称大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1及其应用(57)摘要本发明公开了大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1及其应用。本发明大豆始花期主效QTL位点位于大豆第15号染色体Gm15:48600kb-49850kb区间，分子标记位于大豆第15号染色体Gm15:49588kb。该分子标记的上游引物序列为SeqIDNO.1，下游引物序列为SeqIDNO.2。在用该引物对扩增NJZNRIL群体中始花期长短不同的两组材料及新配置的次级群体中，含有180bp特异DNA片段的材料有一个较大的始花期表型值。本发明所提供的分子标记可用于大豆品种或品系始花期长短的筛选或鉴定，提高育种效率。CN105671039ACN105671039A权利要求书1/1页1.大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1，其特征在于：所述大豆始花期主效QTL位点位于大豆第15号染色体Gm15:48600kb-49850kb，所述分子标记indel15-1位于大豆第15号染色体Gm15:49588kp。2.根据权利要求1所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1，其特征在于：所述分子标记的上游引物序列为SeqIDNO.1，下游引物序列为SeqIDNo.2。3.一种扩增权利要求1所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1的引物对，其特征在于：所述引物对的上游引物序列为SeqIDNO.1，下游引物序列为SeqIDNO.2。4.权利要求1所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1或权利要求3所述的扩增权利要求1所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1的引物对在检测所述的大豆始花期主效QTL中的应用。5.一种利用权利要求1所述分子标记或权利要求3所述引物对检测所述的大豆始花期主效QTL的方法，其特征在于：利用权利要求3所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1的引物对扩增大豆基因组DNA，扩增产物在8％聚丙烯酰胺凝胶电泳后，获得180～210bp的扩增片段，则表明存在所述的大豆始花期主效QTL。6.权利要求1所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1或权利要求3所述的扩增权利要求1所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1的引物对在鉴定大豆始花期长短中的应用。7.一种利用权利要求1所述分子标记或权利要求3所述引物对鉴定大豆始花期长短的方法，其特征在于：利用权利要求3所述的大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1的引物对扩增大豆基因组DNA，扩增产物在8％聚丙烯酰胺凝胶电泳后，获得180bp的扩增片段，则表明存在大豆始花期增效QTL位点，该大豆具有较长的始花期；获得210bp的扩增片段，则表明存在大豆始花期减效QTL位点，该大豆具有较短的始花期。2CN105671039A说明书1/5页大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1及其应用技术领域[0001]本发明涉及大豆分子标记辅助育种，属于大豆遗传育种领域，尤其涉及大豆始花期主效QTL的分子标记indel15-1及其应用。背景技术[0002]大豆始花期是重要的生育期性状之一，是一个复杂数量性状，易受环境因素影响，目前在Soybase上，公布了至少70个大豆始花期QTL，分布在20个连锁群上。大豆始花期不仅是控制大豆由营养生长向生殖生长转变的重要节点，而且前人的研究结果还表明大豆始花期对许多产量相关性状都有影响。在不同大豆产区，都具有与之相适应的生态类型，因此准确预测大豆始花期对筛选适合的大豆品种进行育种具有重要意义。[0003]由于分子标记辅助选择不易受环境因素影响和性状显隐性干扰，可以从分子水平定向选择目标性状基因，克服了简单基于表型选择的常规育种方法中存在的选择效率低和育种周期长等缺点。因此分子标记辅助选择是减少育种时间提高育种效率的一个有效的方法。而分子辅助选择的关键是能否检测到在多环境下控制目标性状的主效QTL及与之紧密连锁的实用分子标记。随着数量性状作图方法、分子生物学和基因组学的迅速发展，数量性状定位以及分子标记技术广泛应用为分子辅助育种提供了基础。发明内容[0004