一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN109880916A(43)申请公布日2019.06.14(21)申请号201910285968.6(22)申请日2019.04.10(71)申请人山东省农业科学院家禽研究所地址250023山东省济南市天桥区交校路1号(72)发明人周艳曹顶国韩海霞雷秋霞刘玮李福伟汤存伟高金波刘杰(74)专利代理机构济南诚智商标专利事务所有限公司37105代理人韩百翠(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书4页序列表2页附图2页(54)发明名称一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用(57)摘要本发明公开了一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用。本发明根据已发表的红色原鸡序列设计一组引物NR11，分别扩增了莱芜黑鸡和海兰褐蛋鸡NR3C2基因3076bp～3846bp的一段序列，序列对比发现鸡NR3C2基因3493位点有G→A的突变，使TaqI–RFLP检测出现多态性。上述PCR产物被TapⅠ限制性内切酶消化后用琼脂糖凝胶电泳检测，可以得到GG、GA、AA三种带型，其中GG基因型与高繁殖性能相关，可以为地方鸡种遗传改良奠定科学依据。CN109880916ACN109880916A权利要求书1/1页1.一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记，其核苷酸序列如SEQIDNo.1所示；在该序列的第418bp处有G→A的碱基突变，导致TaqI-RFLP检测的多态性。2.一种扩增权利要求1所述的分子标记的引物，其特征是，NR11F：5’-AGACAGACAGGGATAG-3’；NR11R：5’-GAGGACACTGAGTTAA-3’。3.权利要求2所述的引物在判断NR3C2基因3493位点基因型方面的应用。4.权利要求2所述的引物在地方鸡种育种方面的应用。5.一种判断NR3C2基因3493位点基因型的方法，其特征是，以鸡的基因组DNA为模板，利用权利要求2所示的引物进行扩增，得到771bp的PCR扩增产物，该PCR产物被TaqI限制性内切酶消化后用琼脂糖凝胶电泳检测，得到GG、GA、AA三种带型，所述GG型的PCR扩增产物能被TaqI切开，检测到417bp，51bp和303bp三条条带；所述AA型的PCR扩增产物不能被TaqI切开，检测到468bp和303bp两条条带；所述GA型检测到468bp、417bp、303bp和51bp四条条带。6.一种地方鸡种的育种方法，其特征是，以鸡的基因组DNA为模板，利用权利要求2所示的引物进行扩增，得到771bp的PCR扩增产物，该PCR产物被TaqI限制性内切酶消化后用琼脂糖凝胶电泳检测，得到GG、GA、AA三种带型，所述GG型的PCR扩增产物能被TaqI切开，检测到417bp，51bp和303bp三条条带；所述AA型的PCR扩增产物不能被TaqI切开，检测到468bp和303bp两条条带；所述GA型检测到468bp、417bp、303bp和51bp四条条带，其中GG型与高繁殖性能相关，用于地方鸡种的育种。7.如权利要求6所述的一种地方鸡种的育种方法，其特征是，在产蛋性能较低的地方品种中，选择GG基因型个体留种，用于提高开产日龄以及总产蛋量。2CN109880916A说明书1/4页一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用技术领域[0001]本发明涉及一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用，属于分子遗传学领域。背景技术[0002]盐皮质激素受体(MR,NR3C2)是核受体超家族中的一员，该超家族是一类配体依赖性转录因子，在多细胞生物中是含量最丰富的几大类转录因子超家族之一。核受体的功能一般途径为配体与相应核受体结合诱导受体的二聚化并增强其与特定DNA序列的结合，从而激活或抑制下游基因的表达。NR3C2的表达范围很广，在肾脏极化的紧密上皮，在人类和鼠的大肠、气道、汗腺、唾液腺、肝脏、内皮的上皮组织、脂肪组织，在单核细胞、B淋巴细胞和T淋巴细胞中均有表达，另外在番鸭的肝、肾、脑、腿、胆和胸中也有表达。NR3C2分布的广泛性揭示了它功能的多样性，目前其被研究最多的功能是与人类疫病相关，比如肾细胞癌、胰腺癌、肝癌等肿瘤发生，高血压、1型假性醛固酮减少症、高原肺水肿、慢性中心性浆液性脉络膜视网膜病变等，此外NR3C2还被发现与行为异常及精神分裂等有关，近来也有研究表明NR3C2参与脂类代谢，在脂肪性肥胖中发挥作用。在动物中，NR3C2的相关研究并不多，研究表明其表达水平在番鸭不同行为状态下存在差异，其单核苷酸变异与猪的肥胖相关，对内洛尔牛的研究表明，其单倍型与肉牛的肉色、烹饪损失、肌肉糖原含量和血浆促肾上腺皮质激素