一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和猪育种中的应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114574593A(43)申请公布日2022.06.03(21)申请号202210087229.8(22)申请日2022.01.25(71)申请人湖北省农业科学院畜牧兽医研究所地址430064湖北省武汉市洪山区南湖瑶苑特4号畜牧所(72)发明人张宇周佳伟吴俊静徐忠李梓芃孙华乔木彭先文梅书棋(74)专利代理机构武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙)42231专利代理师张璐(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书4页序列表1页附图1页(54)发明名称一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和猪育种中的应用(57)摘要本发明公开了一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和猪育种中的应用，其中所述乳头数性状为左侧乳头数性状、右侧乳头数性状和总乳头数性状；所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQIDNO.1所示，在该序列的第356bp处存在一处C>T碱基突变。本发明还提供了一种用于扩增上述分子标记的引物对以及利用上述分子标记进行选育的方法。本发明首次发掘了猪ENSSSCG00000002825基因中的一个SNP分子标记与猪的左侧乳头数性状、右侧乳头数性状和总乳头数性状相关，因此可用于猪标记辅助选择育种，即提供了猪ENSSSCG00000002825基因中一个SNP分子标记在猪乳头数性状的标记辅助育种的新用途，实现了对猪乳头数性状的早期筛选，筛选方法简单快速。CN114574593ACN114574593A权利要求书1/1页1.一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和/或猪育种中的应用，其特征在于，所述乳头数性状为左侧乳头数性状、右侧乳头数性状和总乳头数性状；所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQIDNO.1所示，在该序列的第356bp处存在一处C>T碱基突变。2.根据权利要求1所述的一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和/或猪育种中的应用，其特征在于，序列SEQIDNO.1中第356bp处的C或T碱基多态性位点，表现为CC、TC或TT三种基因型，其中T等位基因为优势等位基因。3.一种用于扩增权利要求1所述的分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括：上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示。4.如权利要求3所述的引物对在猪乳头数性状筛选和/或猪育种中的应用。5.一种试剂盒，其特征在于，包含权利要求3所述的引物对。6.一种猪乳头数性状筛选和/或猪选育的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、提取猪的基因组DNA；S2、以步骤S1得到的基因组DNA作为模板，采用如权利要求3所述的引物对进行PCR扩增，得到如权利要求1所述的分子标记并纯化；S3、对步骤S2纯化后的分子标记进行测序分析，保留该序列第356bp处携带有T等位基因的个体，淘汰携带有C等位基因的个体。7.根据权利要求6所述猪乳头数性状筛选和/或猪育种猪选育的方法，其特征在于，步骤S1中，从待测猪的耳缘组织中提取基因组DNA。8.根据权利要求6所述猪乳头数性状筛选和/或猪育种猪选育的方法，其特征在于，步骤S2中，PCR反应体系50μL，体系中各组分为：基因组DNA100ng、PCRmix25μL、上述上下游引物各1μL、加ddH2O补至总体积50μL；PCR的运行程序为：94℃预变性3min；94℃变性30s，56℃退火30s，72℃延伸30s，35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。2CN114574593A说明书1/4页一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和猪育种中的应用技术领域[0001]本发明涉及猪分子标记技术领域，具体涉及一种猪SNP分子标记在猪乳头数性状筛选和猪选育中的应用。背景技术[0002]猪的繁殖性状是种猪选育的重要性状、是衡量猪场经济效益的重要组成部分。随着产仔数性状的不断提高，与泌乳力息息相关的乳头数性状越来越重要。乳头数是离散的可数性状，受多基因共同调控，其主效基因目前尚不明确。因此，寻找控制猪乳头数性状的关键分子遗传标记，并将其用于分子标记辅助育种，对提高猪的乳头数性状，增加经济效益具有重要意义。[0003]用于MAS的分子标记包括蛋白质标记，微卫星标记，单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism，SNP)标记等。SNP标记指由基因组单核苷酸变异引起的DNA序列多态性，包括碱基转换、颠换、单碱基插入或缺失等，被公认为是最新的第三代DNA分子标记。[0004]ENSSSCG00000002825基因(Carboxylesterase1)编码一种重要的羧酸酯酶，参与大量外源物质以及具有酯、硫酯或酰胺键的