一种猪精液品质性状关联的SNP遗传标记及应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN113215277A(43)申请公布日2021.08.06(21)申请号202110550301.1(22)申请日2021.05.19(71)申请人华中农业大学地址430070湖北省武汉市洪山区狮子山街1号(72)发明人李凤娥白嵘宋惠彬李家连陈大可杨鑫鹏汤金华冯越(74)专利代理机构武汉宇晨专利事务所(普通合伙)42001代理人张红兵(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书5页序列表2页附图1页(54)发明名称一种猪精液品质性状关联的SNP遗传标记及应用(57)摘要本发明属于猪分子标记筛选与应用领域，涉及一种猪精液品质性状关联的SNP遗传标记及应用。该遗传标记克隆自SPAG6基因第7外显子，所述猪精液品质性状为猪精液量、精子密度、精子活力和精子畸形率，所述猪的品种为杜洛克猪、大白猪和长白猪的公猪，所述遗传标记的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示，在该序列的395位存在一个T或C的碱基替换，该替换导致ClaI‑RFLP多态性，该位点分别是检测杜洛克猪、大白猪和长白猪的精子活力的位点；检测长白猪和大白猪的精子密度的位点；检测长白猪的精液量的位点。CC基因型为个体精子活力性状的优势基因。本发明还提供了一种引物组合在猪精液品质性状辅助选择中的应用。CN113215277ACN113215277A权利要求书1/1页1.一种遗传标记在猪精液品质性状辅助选择中的应用，所述猪精液品质性状为精液量、精子密度、精子活力和精子畸形率，所述猪的品种为杜洛克猪、大白猪和长白猪的公猪，所述遗传标记的核苷酸序列如下所示：AGTCTGACCTCGCCTTTCAGCATTCAGTGATTAACCCATGCCTTGTGATGAGGGGTTTCATCAGTTAGCTAGTTATGAACTAGCCCTCAGCTTAGAGTTTAGGTAAGAACTTTTGACCTCCATTATGATAGGGGTAAAAGTTTTACATGATAAATTGGACCACAGAGAGGCTCCTCACAGTGGGCGAATTCTTTGATAAATGTCATAATTTCACTAAATGATATTTCACATTTTACCAGATTTTTTTTTAGGTCCTAAAATTTAAAATCTGGCAGTGCTCATATAATATTGAAAGTTCCTTTACACTATAGGGTCATGGTTATCTAGCTCTCCTTCTTTTCTCTTAGCTTTCACAGTTGATAGTTAATGCGGGCGGAGTGGCTGCGGTGATCGARTGCATCGGGTCCTGCAAAGGAAACATAAGGCTGCCAGGCATCATGATGCTGGGCTATGTGGCAGCTCATTCTGAGAACCTGGCCATGGCAGTCATCATCTCCAAGGTTCGTTCTTGCTTCATTTTCCTCTAGTTATGCAACGAGATGCACCAAGA，上述序列中的395位的碱基R是T或C，该突变导致ClaI‑RFLP多态性，该位点是检测杜洛克猪、大白猪和长白猪的精子活力的位点，CC基因型为优势基因型；是检测长白猪和大白猪的精子密度的位点，TC基因型为优势基因型；是检测长白猪的精液量的位点，CC基因型为优势基因型。2.一种引物组合在猪精液品质性状辅助选择中的应用，所述猪精液品质性状为精液量、精子密度、精子活力和精子畸形率，所述猪的品种为杜洛克猪、大白猪和长白猪，所述引物组合的序列如序列表SEQIDNO：2和SEQIDNO：3所示。2CN113215277A说明书1/5页一种猪精液品质性状关联的SNP遗传标记及应用技术领域[0001]本发明属于猪遗传标记筛选与应用技术领域，具体涉及一种猪精液品质性状关联的SNP遗传标记及应用。该SNP遗传标记克隆自SPAG6基因。所述遗传标记可用于公猪精子活力性状的辅助选择。背景技术[0002]养猪生产中，公猪精液品质直接影响其繁殖效率，是衡量公猪生产效益的重要指标之一。公猪养殖受多种因素调控，如遗传改良、疾病防治、饲养管理水平、生产环境等，其中遗传改良占主导作用，而提高公猪精液品质对规模化养猪生产和公猪的遗传改良具有重要意义。公猪精液品质主要包括精液量、精子浓度、精子活力和精子畸形率等四个指标。其中，精子活力受精子鞭毛“9+2”轴丝结构中双联微管两侧的动力蛋白臂所调节，因此精子活力的强弱对公猪精液品质的好坏具有较大影响。一般认为，完整精子的正常运动能力是保障精子受精成功的基础条件。因此，改良公猪的精液品质有利于提升规模化养殖的经济效益，而标记辅助选择是改善公猪精液品质的有效方法。[0003]精子相关抗原6(sperm‑ass