一种猪SNP分子标记及其在猪肉质性状筛选和育种中的应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115927658A(43)申请公布日2023.04.07(21)申请号202211147346.5C12N15/11(2006.01)(22)申请日2022.09.19(71)申请人湖北省农业科学院畜牧兽医研究所地址430064湖北省武汉市洪山区南湖瑶苑特4号畜牧所(72)发明人徐忠周佳伟张宇徐珂李梓芃梅书棋彭先文吴俊静乔木孙华宋忠旭赵海忠李良华(74)专利代理机构武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙)42231专利代理师张杰(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6806(2018.01)权利要求书1页说明书4页序列表2页附图1页(54)发明名称一种猪SNP分子标记及其在猪肉质性状筛选和育种中的应用(57)摘要本发明公开了一种猪SNP分子标记及其在猪肉质性状筛选和育种中的应用，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQIDNO.1所示，且在该序列的第260bp处存在A/C多态性位，并进一步构建了利用该分子标记进行猪肉质性状筛选和育种的方法。本发明首次发掘了猪PVALB基因中与猪肉质性状相关的SNP分子标记，尤其是与猪的肌内脂肪含量和大理石纹评分性状相关，其可用于猪标记辅助选择育种，实现对猪肉质性状的早期筛选，且筛选方法简单快速，对猪肉质性状的遗传改良具有潜在的重要价值。CN115927658ACN115927658A权利要求书1/1页1.一种猪SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示，在SEQIDNO.1所示序列的第260bp处存在A/C多态性位点。2.根据权利要求1所述的猪SNP分子标记，其特征在于，A等位基因为优势等位基因。3.一种用于扩增权利要求1所述猪SNP分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的序列如SEQIDNO.2～3所示。4.如权利要求1所述的猪SNP分子标记，或权利要求3所述的引物对在猪肉质性状筛选中的应用。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述猪肉质性状为肌内脂肪含量和大理石纹评分。6.如权利要求1所述的猪SNP分子标记，或权利要求3所述的引物对在猪育种的应用。7.根据权利要求6所述应用，其特征在于，具体为：以待测猪只的基因组DNA为模板，通过PCR扩增得到如权利要求1所述的分子标记并纯化，对分子标记进行测序分析，保留该序列第260bp处携带有A等位基因的个体，淘汰携带有C等位基因的个体。8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述待测猪只的基因组DNA从待测猪只的耳缘组织中提取。9.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述PCR扩增的体系为：共50μL，基因组DNA100ng、PCRmix25μL、上下游引物各1μL、ddH2O余量。10.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述PCR扩增的程序为：94℃预变性3min；94℃变性30s，58℃退火30s，72℃延伸30s，35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。2CN115927658A说明书1/4页一种猪SNP分子标记及其在猪肉质性状筛选和育种中的应用技术领域[0001]本发明属于分子标记技术领域，具体涉及一种猪SNP分子标记及其在猪肉质性状筛选和猪选育中的应用。背景技术[0002]猪肉品质是猪的重要经济形状，提高猪肉品质是目前种猪选育工作的重要目标之一，同时也是满足消费者对猪肉质量、食品健康和营养需求的重要保障。其中，肌内脂肪(IntramuscularFat,IMF)含量和大理石纹评分是评价猪肉品质的两个重要指标，其与猪肉的风味、嫩度和多汁性等指标存在显著相关。虽然肉质性状如IMF的遗传力较高，在0.2‑0.4之间，但由于肉质性状的活体测定较为困难，通过常规育种改良较为困难。因此寻找影响肉质性状的分子标记，通过分子标记辅助育种(MarkerAssistedSelection,MAS)对提高猪肉质具有重要意义。[0003]MAS利用与特定性状相关联的分子标记作为辅助手段进行选择育种，具有快速、准确、不受环境影响等优点，不仅能大大减少育种的人力物力消耗，而且能缩短育种时限。用于MAS的分子标记包括蛋白质标记、微卫星标记、单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphsim,SNP)标记等。[0004]单核苷酸多态性指基因组DNA序列中单个核苷酸的突变而引起的基因多态性。由于SNP分布的广泛性和稳定性，在动物分子标记辅助选择育种上发挥着重要作用。挖掘猪肉质性状相关的SNP，能有效加快猪肉质性状遗传改良的进程。发明内容[0005]有鉴于此，本发明的目的在于提供一种与猪肉质性状相关的猪SNP分子标记，并进一步构建其在猪肉质性状筛选和猪选育中的应用方法。[0006]为了实现上述目的，本发