与菠菜抽薹主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115725767A(43)申请公布日2023.03.03(21)申请号202111010364.4(22)申请日2021.08.31(71)申请人中国农业科学院蔬菜花卉研究所地址100081北京市海淀区中关村南大街12号(72)发明人刘志远钱伟徐兆生张合龙孟庆王晓武武剑(74)专利代理机构北京路浩知识产权代理有限公司11002专利代理师孙怡(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书6页序列表2页附图2页(54)发明名称与菠菜抽薹主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用(57)摘要本发明涉及分子遗传学技术领域，具体涉及与菠菜抽薹主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用。本发明提供的SNP分子标记为KMBL29，其多态性位点位于菠菜1号染色体的第47693313位，多态性为A/G。基因型为AA时，对应于菠菜耐抽薹；基因型为AG或GG时，对应于菠菜易抽薹。本发明还提供基于KASP技术的用于该SNP分子标记分型的特异性引物。该分子标记和引物可用于选育耐抽薹的优质菠菜品种，缩短育种年限。CN115725767ACN115725767A权利要求书1/1页1.与菠菜抽薹主效QTL紧密连锁的SNP分子标记，其特征在于，其为分子标记KMBL29，其多态性位点位于菠菜1号染色体的第47693313位，多态性为A/G。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示，多态性位点位于如SEQIDNO.1所示序列的第36位，多态性为A/G。3.根据权利要求1或2所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记由序列如SEQIDNO.2和SEQIDNO.4所示的引物扩增得到，或者由序列如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示的引物扩增得到。4.根据权利要求1～3任一项所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的基因型为AA，对应于菠菜耐抽薹；所述SNP分子标记的基因型为AG或GG，对应于菠菜易抽薹。5.用于检测权利要求1～4任一项所述的SNP分子标记的特异性引物组，其特征在于，其包含具有如SEQIDNO.2‑3所示序列的正向引物以及具有如SEQIDNO.4所示序列的反向引物；优选地，所述正向引物的5’端还连接有荧光标签序列。6.含有权利要求5所述的特异性引物组的试剂盒。7.权利要求1～4任一项所述的SNP分子标记或权利要求5所述的特异性引物组或权利要求6所述的试剂盒的如下任一种应用：(1)在鉴定菠菜抽薹特性中的应用；(2)在耐抽薹菠菜的分子标记辅助育种中的应用；(3)在菠菜抽薹性状的种质资源改良中的应用。8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，所述应用包括：以待测菠菜植株的DNA为模板，采用具有如SEQIDNO.2‑4所示序列的引物进行PCR扩增，根据PCR扩增产物判断待测菠菜植株的抽薹特性。9.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，所述PCR扩增的反应程序如下：(1)94℃、15分钟；1个循环；(2)94℃、20秒，61‑55℃、60秒、每个循环降低0.6℃；10个循环；(3)94℃、20秒，55℃、60秒；26个循环；上述反应程序结束后进行荧光检测分析，若分型结果不理想，则再进行如下反应程序：(4)94℃、20秒，57℃、60秒；3‑9个循环，结束后再次进行荧光检测分析；优选地，所述PCR扩增的反应体系中，具有SEQIDNO.2、SEQIDNO.3、SEQIDNO.4所示序列的引物的摩尔比为1:1:2。10.根据权利要求8或9所述的应用，其特征在于，若读取到的荧光信号仅为具有SEQIDNO.2所示序列的引物对应的荧光信号，则判断待测菠菜植株耐抽薹；若读取到的荧光信号仅为具有SEQIDNO.3所示序列的引物对应的荧光信号或者读取到的荧光信号为具有SEQIDNO.2和SEQIDNO.3所示序列的引物对应的荧光信号，则判断待测菠菜植株易抽薹。2CN115725767A说明书1/6页与菠菜抽薹主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用技术领域[0001]本发明涉及分子遗传学技术领域，具体涉及与菠菜抽薹主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用。背景技术[0002]菠菜(SpinaciaoleraceaL.,2n＝2x＝12))属苋科藜亚属植物，原产伊朗，是主要以绿叶为产品器官的一、二年生草本植物。因其适应性广、耐储藏、供应期长、栽培方式多样，营养比较全面，在世界各地普遍种植。[0003]菠菜的耐寒性和适应性很强，生长期较短，一年内可多茬栽培，而菠菜抽薹对光周期的敏感性，使得春夏种植菠菜容易发生早抽薹，降