与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记及其应用与检测方法.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115786527A(43)申请公布日2023.03.14(21)申请号202210876247.4(22)申请日2022.07.25(71)申请人三亚中国农业大学研究院地址572025海南省三亚市崖州区创意用友产业园8号楼(72)发明人方美英何帅涵王余北汤启国雒亚彪产舒恒薛明明(74)专利代理机构北京集佳知识产权代理有限公司11227专利代理师温可睿(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书6页序列表（电子公布）附图1页(54)发明名称与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记及其应用与检测方法(57)摘要本发明涉及分子遗传学领域，尤其涉及与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记及其应用与检测方法。本发明发现DKK2基因内含子区第12726碱基或猪八号染色体第114874954一处SNP位点(A‑C)，等位基因A与低肌内脂肪性状呈正相关，而等位基因C与高肌内脂肪性状呈正相关。本发明提供了检测该SNP分子标记的方法与试剂盒，若酶切产物为两条，突变处碱基为A；若酶切产物为一条，则突变处碱基为C。本发明方法能够早期、快速、低成本、有效的预测猪肌内脂肪含量，可作为分子标记应用于猪种的遗传改良。在猪种改良方面具有广阔的应用和市场前景，针对此发明开发的试剂盒，具有可观的经济效益和良好的社会效益。CN115786527ACN115786527A权利要求书1/1页1.与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记位于猪DKK2基因内含子区第12726位碱基或猪八号染色体第114874954位碱基，该位点的碱基为A或C。2.权利要求1所述SNP分子标记在检测猪肌内脂肪性状中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述脂肪性状包括肌内脂肪含量。4.检测权利要求1所述SNP分子标记基因型的引物对，其特征在于，所述引物对分为上游引物和下游引物，所述上游引物具有如SEQIDNO.1所示的核苷酸序列；所述下游引物具有如SEQIDNO.2所示的核苷酸序列。5.检测权利要求1所述SNP分子标记基因型的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求4所述的引物对。6.检测与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记的方法，其特征在于，包括使用权利要求4所述的引物对和/或权利要求5所述的试剂盒检测待测物。7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述方法包括使用权利要求4所述的引物对或权利要求5所述的试剂盒，PCR扩增待测猪基因组DNA，对PCR产物用BspHI内切酶进行酶切，若酶切产物为399bp和179bp，突变处碱基为A；若酶切产物为578bp，则突变处碱基为C。8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增反应程序为：95℃5min；95℃30s，59℃30s，72℃35s，共35个循环；72℃10min；4℃∞；所述酶切反应程序为：37℃，过夜；65℃20min：4℃∞。9.如下I～III中的任一项在猪种质资源改良和/或选育高或适宜肌内脂肪猪种中的应用:I：权利要求1所述的SNP分子标记；II：权利要求4所述的引物对；III：权利要求5所述的试剂盒。10.猪的育种方法，其特征在于，所述方法包括使用权利要求4所述的引物对或权利要求5所述的试剂盒对亲本或子代的基因型进行检测。2CN115786527A说明书1/6页与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记及其应用与检测方法技术领域[0001]本发明涉及分子遗传学领域，尤其涉及与猪肌内脂肪性状相关的SNP分子标记及其应用与检测方法。背景技术[0002]中国是猪肉生产及消费大国，猪肉在国民生活中占有重要地位。2021年，全国肉类产量8887.0万吨，其中猪肉产量5296.0万吨，占肉类总产量的59.6％，生猪及猪肉产业关系着社会的稳定与民生的根本。目前国内猪肉市场主要以瘦肉型猪为主，其生长速度快，瘦肉率高，然而早期猪选种计划中没有将肉质纳入选种改良目标，使得市场上猪肉的肉品质与风味情况良莠不齐。随着人民生活水平的提高，消费者们在选购时会更加关注猪肉的肉质。这种需求在推动市场转变的同时也带动了行业的革新。生产肉质鲜嫩、风味独特、营养丰富的猪肉成了养殖业及相关工作者的新目标。[0003]猪肉肉质狭义的定义为人对猪肉最直观的感官品质，如视觉、嗅觉、味觉和触觉等，具体的猪肉品质可以通过下列指标进行评价：肉色、肌肉系水力、风味、pH值、滴水损失、大理石纹、系水力、嫩度、风味、多汁性等。而广义的肉品质还包括肉的深加工品质、营养价值和卫生质量等。已有大量文献报道肌内脂肪含量及其脂肪酸组成既是肌肉呈现大理石纹的原因，也与猪肉多汁性、嫩度