一种与猪肌内脂肪性状相关的分子标记、引物及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115927667A(43)申请公布日2023.04.07(21)申请号202211549819.4C12N15/11(2006.01)(22)申请日2022.12.05(71)申请人湖北省农业科学院畜牧兽医研究所地址430064湖北省武汉市洪山区南湖瑶苑特4号畜牧所(72)发明人周佳伟张宇梅书棋彭先文吴俊静乔木徐忠李梓芃冯越李康驰杨涛孙华宋忠旭李良华赵海忠(74)专利代理机构武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙)42231专利代理师张杰(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)权利要求书1页说明书4页序列表（电子公布）附图1页(54)发明名称一种与猪肌内脂肪性状相关的分子标记、引物及其应用(57)摘要本发明公开了一种与猪肌内脂肪性状相关的分子标记、引物及其应用，所述分子标记为对应于猪AOPEP基因第二外显子中序列如SEQIDNO.1所示DNA分子第349bp处的核苷酸，为T/C多态，所述引物序列如SEQIDNO.2～3所示；该分子标记和引物用于猪选育时，能够显著提高育种效率，有效缩短育种周期，且育种准确性高，成本低廉。CN115927667ACN115927667A权利要求书1/1页1.一种与猪肌内脂肪性状相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记为对应于猪AOPEP基因第二外显子中序列如SEQIDNO.1所示DNA分子第349bp处的核苷酸，为T/C多态。2.根据权利要求1所述与猪肌内脂肪性状相关的分子标记，其特征在于，所述第349bp处的优势等位基因型为TT。3.一种用于扩增权利要求1所述与猪肌内脂肪性状相关的的引物，其特征在于，所述引物的序列如SEQIDNO.2～3所示。4.如权利要求1所述与猪肌内脂肪性状相关的分子标记或如权利要求3所述引物的应用，为下述A1)至A3)中的任一种：A1)鉴定或辅助鉴定猪肌内脂肪性状中的应用；A2)猪育种；A3)筛选高肌内脂肪含量猪品种。5.一种鉴定或辅助鉴定猪肌内脂肪性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：1)提取猪基因组DNA作为模板；2)针对SEQIDNO.1所示DNA分子的第349位点设计引物，进行PCR扩增；3)检测待测猪SEQIDNO.1所示序列的第349位点的基因型。6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，步骤2)所述引物的序列如SEQIDNO.2～3所示。7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的条件为：94℃预变性3min；94℃变性30s，62℃退火30s，72℃延伸45s，共35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。8.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的体系为：共50μL，100ng模板DNA、10×buffer4μL、上下游引物各0.5μM、2.5μMdNTPs、1UTaqDNA聚合酶，ddH2O余量。9.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，在步骤3)中，CC基因型的肌内脂肪高于CT基因型和TT基因型。10.一种猪育种方法，其特征在于，按照权利要求5～9任一权利要求所述的方法检测待测猪的基因型，选择CC基因型猪进行育种。2CN115927667A说明书1/4页一种与猪肌内脂肪性状相关的分子标记、引物及其应用技术领域[0001]本发明属于分子标记辅助选择育种技术领域，具体涉及一种与猪肌内脂肪性状相关的分子标记、引物及其应用。背景技术[0002]肌内脂肪含量是猪肉品质的重要评定指标，肌内脂肪含量直接影响了猪肉口感和风味。肌内脂肪性状属于中等遗传力性状，遗传力在0.2‑0.4之间，但由于肉质性状的活体测定较为困难，通过常规育种改良较为困难。因此寻找影响肉质性状的分子标记，通过常规育种与标记辅助选择(MAS)相结合的方法，可以加快猪肌内脂肪性状的遗传改良。[0003]MAS利用与特定性状相关联的分子标记作为辅助手段进行选择育种，具有快速、准确、不受环境影响等优点，能够减少现场测定人员的工作量，且能缩短育种时限。单核苷酸多态性(SNP)指基因组DNA序列中单个核苷酸的突变而引起的基因多态性，在基因组中广泛存在，常被通过MAS的方法应用于育种实践中，对重要性状的遗传改良具有关键作用。[0004]AOPEP基因是编码M1氨基氧化锌肽酶家族的一个成员。编码的蛋白质是一种锌依赖的金属肽酶，参与肽类激素代谢和蛋白质代谢等相关途径，可能在血管紧张素IV的生成和肌张力障碍中发挥作用。发明内容[0005]有鉴于此，本发明提供了一个位于猪AOPEP基因第二外显子内与猪肌内脂肪性状相关的分子标记，该分子标记可为猪肉质性状标记辅助选择提供参考依据。[0006]本发明的技术方案具体如下：[0007]一种猪AOPEP基因内与猪肌内脂肪性状相