与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115852031A(43)申请公布日2023.03.28(21)申请号202211449316.X(22)申请日2022.11.18(71)申请人河南农业大学地址450000河南省郑州市金水区文化路95号(72)发明人胡建斌梁晓雪曹磊李琼王盼乔李翔侯娟毛文文(74)专利代理机构郑州德勤知识产权代理有限公司41128专利代理师王莉(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书10页序列表（电子公布）附图4页(54)发明名称与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记及其应用(57)摘要本发明提供了一种与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记，甜瓜4号染色体上包含4个SNP标记，分别为：标记Chr4_12085945，等位基因T/C；标记Chr4_12894435，等位基因T/A；标记Chr4_13382545，等位基因C/T；标记Chr4_15435120，等位基因C/A。其中SNP标记Chr4_13382545位点与甜瓜种子长度、宽度、千粒重三个性状相关，可准确区分甜瓜种子大小。本发明还提供一种上述SNP标记在甜瓜种子大小性状分子标记辅助育种中的应用，能提高选择的准确性、加快新品种培育的进程。本发明提供一种利用上述SNP标记筛选甜瓜种子大小的方法。CN115852031ACN115852031A权利要求书1/1页1.一种与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记，其特征在于：甜瓜4号染色体上包含与甜瓜种子的长度、宽度、千粒重三个性状中的至少两个性状相关的4个SNP标记，分别为：标记Chr4_12085945，物理位置为12085945bp，等位基因为T/C；标记Chr4_12894435，物理位置为12894435bp，等位基因为T/A；标记Chr4_13382545，物理位置为13382545bp，等位基因为C/T；标记Chr4_15435120，物理位置为15435120bp，等位基因为C/A。2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于：所述标记Chr4_12085945与甜瓜种子的长度和千粒重性状紧密连锁；所述标记Chr4_12894435与甜瓜种子的长度和宽度性状紧密连锁；所述标记Chr4_13382545与甜瓜种子的长度、宽度和千粒重性状紧密连锁；所述标记Chr4_15435120与甜瓜种子的宽度和千粒重性状紧密连锁。3.根据权利要求2所述的SNP标记，其特征在于：所述标记Chr4_13382545同时与甜瓜种子长度、宽度、千粒重三个性状共分离，当所述标记Chr4_13382545在13382545位点处基因型为T时，甜瓜种子为大种子；基因型为C时，甜瓜种子为小种子。4.一种权利要求3所述的SNP标记的引物，其特征在于：所述标记Chr4_13382545的特异性引物序列分别为SEQIDNO:2～3所示。5.一种含权利要求3所述的SNP标记的核苷酸，其特征在于：标记Chr4_13382545的核苷酸序列为SEQIDNO:1所示，其为利用SEQIDNO:2～3扩增出大小为240bp的含标记Chr4_13382545的特征条带。6.一种含有权利要求4所述的引物或权利要求5所述的核苷酸的试剂盒。7.权利要求1或2或3所述的SNP标记、权利要求4所述的引物、权利要求5所示的核苷酸或权利要求6所示的试剂盒在甜瓜种子大小性状分子标记辅助育种中的应用。8.权利要求1或2或3所述的SNP标记、权利要求4所述的引物、权利要求5所示的核苷酸或权利要求6所示的试剂盒在筛选甜瓜种子大小中的应用。9.一种筛选甜瓜种子大小的方法，包括以下步骤：提取待测甜瓜植株的基因组DNA；以所述待测甜瓜植株的基因组DNA为模板，利用权利要求4所述的引物、权利要求5所示的核苷酸或权利要求6所示的试剂盒进行PCR扩增反应；纯化PCR扩增反应的产物并检测其基因型；当检测的基因型为T时，所述甜瓜种子为大种子；当检测的基因型为C时，所述甜瓜种子为小种子。2CN115852031A说明书1/10页与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记及其应用技术领域[0001]本发明属于生物技术领域，具体涉及一种与甜瓜种子大小性状共分离的SNP标记及其应用。背景技术[0002]甜瓜(CucumismeloL.)是主要的葫芦科蔬菜作物之一，栽培面积广泛，具有重要的经济价值。中国是甜瓜生产大国，甜瓜在果蔬生产中占有重要地位。种子是植物生命的起点和终点，是植物生长发育的重要决定因素。在许多以种子为主要生产器官的作物的驯化和育种过程中，种子大小是植物进化适宜性的关键农艺特征，也是影响种子产量、食用质量和对环境胁迫耐受性的关键因素。种子大小是重要的农艺性状，在植物进化中起着至关重