与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114525350A(43)申请公布日2022.05.24(21)申请号202210424065.3(22)申请日2022.04.22(71)申请人三亚中国农业大学研究院地址572025海南省三亚市崖州区崖州湾科技城标准厂房二期三楼C314区(72)发明人刘国世吴昊刘奋泽姚松阳马文奎易琪张鲁徐尚周强(74)专利代理机构北京睿阳联合知识产权代理有限公司11758专利代理师景鹏张颖(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书13页序列表2页附图6页(54)发明名称与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记及其应用(57)摘要本发明涉及与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记、特异性扩增SNP标记的引物对、特异性扩增SNP位点的试剂盒、鉴定湖羊的SNP标记的方法、预测湖羊的褪黑素表达的方法、及引物对或试剂盒的应用。CN114525350ACN114525350A权利要求书1/1页1.一种与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记包括：所述基因组NC_040262.1的第7981372位和/或第7981866位碱基；基因组NC_040277.1的第17355171位碱基。2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记包括：所述基因组NC_040262.1的所述第7981372位碱基是G或C，和/或所述第7981866位碱基是G或A；和/或所述基因组NC_040277.1的所述第17355171位碱基是G或T。3.一种特异性扩增权利要求1或2所述的SNP标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括；如SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示的引物对，其用于特异性扩增所述第7981372位的SNP标记和/或所述第7981866位的SNP标记；和/或如SEQIDNO:9和SEQIDNO:10所示的引物对，其用于特异性扩增所述第17355171位的SNP标记。4.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括如权利要求3所述的引物对。5.一种鉴定湖羊的SNP标记的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：提取湖羊的基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，使用如权利要求3所述的引物对进行PCR扩增反应，得到扩增产物；分析所述扩增产物。6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：当所述基因组NC_040262.1的第7981372位基因型为CG或CC、第7981866位基因型为GA或AA，和/或所述基因组NC_040277.1的第17355171位的基因型为GG时，对应的湖羊的褪黑素表达量高。7.一种预测湖羊的褪黑素表达的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：提取湖羊的基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，使用如权利要求4所述的引物对进行PCR扩增反应，得到扩增产物；分析所述扩增产物。8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述方法还包括：当所述基因组NC_040262.1的第7981372位基因型为CG或CC、第7981866位基因型为GA或AA，和/或所述基因组NC_040277.1的第17355171位的基因型为GG时，对应的湖羊的褪黑素表达量高。9.如权利要求3所述的引物对在湖羊育种中的应用。10.如权利要求4所述的试剂盒在湖羊育种中的应用。2CN114525350A说明书1/13页与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记及其应用技术领域[0001]本发明生物工程技术领域，具体地，本发明涉及与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记、特异性扩增SNP标记的引物对、特异性扩增SNP标记的试剂盒、鉴定湖羊的SNP标记的方法、预测湖羊的褪黑素表达的方法、及引物对或试剂盒的应用。背景技术[0002]我国是种业大国，却不是种业强国，绵羊品种资源丰富，却缺少当家品种。湖羊（Husheep）属绵羊属（Ovisaries），是我国特有的绵羊品种，主要在南方地区饲养，内蒙古自治区也有饲养。湖羊的性成熟较早，四季发情，可终年配种，而且多胎性强，在良好的饲养条件下一胎可产2‑3羔，平均产羔率达256%，高繁殖率选育群可达以上300%，其繁殖力之强是世界绵羊品种中少有的。对湖羊多胎机理的研究，主要是探讨了它们的生殖内分泌、卵泡发育、排卵率、子宫内环境以及其产地的生态环境等对其的影响，尚没有确定多胎的主导因素。目前，从分子遗传机制上探讨我国湖羊多胎机理还比较少，现在证明湖羊存在多胎基因FecB，且为一个高度纯化的高产品种。[0003]褪黑素（Melatonin，MT）化学名称为N‑乙酰基‑5‑羟色胺，是一种主要由松果体分泌的激素。在动物体内，褪黑素通过下丘脑‑垂体‑性腺轴直接调控繁殖活动。现在研究证明，生殖系统、消