与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记及应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115927727A(43)申请公布日2023.04.07(21)申请号202211462431.0(22)申请日2022.11.21(71)申请人河南农业大学地址450002河南省郑州市金水区文化路95号(72)发明人胡建斌杜烜宇梁晓雪李琼王盼乔李翔侯娟毛文文杨路明孙守如(74)专利代理机构北京华际知识产权代理有限公司11676专利代理师袁瑞红(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书6页序列表（电子公布）附图1页(54)发明名称与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记及应用(57)摘要本发明公开了一种与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记及应用，扩增所述分子标记的引物对的上游引物序列如SEQIDNO.1所示，下游引物序列如SEQIDNO.2所示。该分子标记引物不仅在分离群体中与结果部位和果实大小性状共分离，在不同育种材料中，其扩增带型也与结果部位和果实大小表型一致，因此可直接用于甜瓜分子标记辅助育种，对于甜瓜新品种培育中具有较好的应用价值。CN115927727ACN115927727A权利要求书1/1页1.与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记，其特征在于，扩增所述分子标记的引物对的上游引物序列如SEQIDNO.1所示，下游引物序列如SEQIDNO.2所示。2.权利要求1所述与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记在甜瓜分子育种中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述InDel分子标记用于鉴定或辅助鉴定甜瓜结果部位和果实大小表型。4.一种甜瓜结果部位和果实大小性状的判定方法，其特征在于，所述判定方法包括如下步骤：(1)提取待测甜瓜基因组DNA；(2)以步骤(1)中所提取基因组DNA为模板，利用权利要求1所述的分子标记引物对对模板进行PCR扩增，对PCR扩增产物进行电泳检测和/或测序；(3)根据步骤(2)的电泳条带和/或测序结果进行判定，具体标准为：如果PCR扩增产物仅有一条如SEQ.ID.NO.3所示的长度为195bp的特征条带，则该待测品种为纯和的主蔓结瓜小果型性状；如果PCR扩增产物仅有一条如SEQ.ID.NO.4所示的长度为202bp的特征条带，则该待测品种为纯合侧蔓结瓜大果型性状；如果PCR扩增产物中既有一条如SEQ.ID.NO.3所示的长度为195bp的特征条带，又有一条如SEQ.ID.NO.4所示的长度为202bp的特征条带，则该待测品种为杂合侧蔓结瓜大果型性状。5.一种用于鉴定甜瓜结果部位和果实大小性状的试剂盒，其特征在于，包含权利要求1中所述的引物对。6.用于检测InDel分子标记是否存在的试剂在控制甜瓜结果部位和果实大小的基因定位中的应用，其特征在于，扩增所述标记的引物对的上游引物序列如SEQIDNO.1所示，下游引物序列如SEQIDNO.2所示。2CN115927727A说明书1/6页与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记及应用技术领域[0001]本发明属于分子育种技术领域，具体涉及与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记及应用。背景技术[0002]甜瓜(CucumismeloL.)是主要的葫芦科蔬菜作物之一，栽培面积广泛，具有重要的经济价值。中国是甜瓜生产大国，甜瓜在果蔬生产中占有重要地位。[0003]近年来，分子辅助选择育种技术得到了广泛的开发及应用，能够在分子水平上快速筛选所需要的个体，极大的缩短了育种时间，对育种工作有着极大的推动。能否找到与性状紧密连锁的标记，能否在不同材料中使用，是分子标记辅助选择育种成功与否的标志。[0004]甜瓜的结果部位和果实大小是甜瓜重要的农艺性状，直接决定甜瓜的株型与产量。果实的结果部位是非常重要的农艺性状，也是株型的重要组成部分，直接决定植物的结构；果实大小是果实完全成熟后的农艺性状，且易受环境影响，是性状改良中的难点。常规育种需要在果实成熟后对果实大小进行鉴定，耗时长、成本高。通过构建遗传群体，BSA‑seq初定位，进一步利用大群体对标记进行加密，进行精细定位并获得与果实大小共分离的分子标记，通过标记辅助选择技术可以定向的改良甜瓜的株型，同时显著提高果实大小的选择效率、在苗期即可对果实大小进行选择，加快育种进程。发明内容[0005]本发明的目的之一在于提供一种与甜瓜结果部位和果实大小共分离的InDel分子标记记。[0006]本发明目的之二在于提供一种上述分子标记在甜瓜分子育种的应用。[0007]本发明的另一目的在于提供一种甜瓜结果部位和果实大小的判定方法。[0008]为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：[0009]与甜瓜结果部位和果实大小共