梅花垂枝性状紧密连锁的纯合SNP分子标记及其检测方法与应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN110819732A(43)申请公布日2020.02.21(21)申请号201911038349.3(22)申请日2019.10.29(71)申请人北京林业大学地址100083北京市海淀区清华东路35号北京林业大学(72)发明人张启翔卓孝康郑唐春孙丽丹袁存权程堂仁王佳(74)专利代理机构北京路浩知识产权代理有限公司11002代理人商秀玲(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)C12N15/29(2006.01)权利要求书1页说明书9页序列表3页附图7页(54)发明名称梅花垂枝性状紧密连锁的纯合SNP分子标记及其检测方法与应用(57)摘要本发明涉及分子生物学及植物分子育种技术领域，具体涉及梅花垂枝性状紧密连锁的纯合SNP分子标记及其检测方法与应用。本发明提供两个梅花垂枝性状紧密连锁的纯合SNP分子标记，分别位于梅花第7号染色体第10245464bp处和第10284630bp处，多态性分别为G/A和G/T。这两个分子标记在垂枝/直枝性状的个体中均表现为纯合基因型，在梅花杂交后代分离群体的垂枝/直枝性状鉴定中重复性好、准确性高，可实现垂枝/直枝性状的幼苗期分子辅助选择，有助于缩短育种周期和提高育种效率。基于该SNP分子标记，本发明还提供梅花垂枝性状调控基因Pm024074，为梅花垂枝性状的调控和遗传育种提供了基础。CN110819732ACN110819732A权利要求书1/1页1.梅花垂枝性状紧密连锁的纯合SNP分子标记，其特征在于，包括：位于梅花第7号染色体第10245464bp处，多态性为G/A，和/或，位于梅花第7号染色体第10284630bp处，多态性为G/T。2.权利要求1所述的SNP分子标记的检测引物，其特征在于，包括：引物对1和/或引物对2：所述引物对1用于检测位于梅花第7号染色体第10245464bp处的SNP分子标记，其序列如SEQIDNO.3-4所示；所述引物对2用于检测位于梅花第7号染色体第10284630bp处的SNP分子标记，其序列如SEQIDNO.6-7所示。3.根据权利要求2所述的检测引物，其特征在于，还包括单碱基延伸引物；其中，与所述引物对1配合使用的单碱基延伸引物的序列如SEQIDNO.5所示；与所述引物对2配合使用的单碱基延伸引物的序列如SEQIDNO.8所示。4.包含权利要求2或3所述的检测引物的试剂盒。5.权利要求1所述的SNP分子标记或权利要求2或3所述的检测引物或权利要求4所述的试剂盒在梅花垂枝或直枝性状鉴定中的应用。6.权利要求1所述的SNP分子标记或权利要求2或3所述的检测引物或权利要求4所述的试剂盒在梅花分子标记辅助育种中的应用。7.一种鉴定梅花垂枝/直枝性状的方法，其特征在于，以待测梅花的基因组为模板，采用权利要求2或3所述的检测引物进行PCR扩增，分析PCR扩增产物的序列，判断所述待测梅花的基因型。8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)以待测梅花的基因组为模板，采用序列如SEQIDNO.3-4和/或SEQIDNO.6-7所示的检测引物进行PCR扩增，将所述PCR扩增的产物用碱性磷酸酶处理；(2)以步骤(1)得到的碱性磷酸酶处理的产物为模板，采用序列如SEQIDNO.5和/或SEQIDNO.8所示的单碱基延伸引物进行单碱基延伸反应；(3)分析步骤(2)得到的单碱基延伸反应的产物的基因型。9.Pm024074基因在梅花枝条性状调控中的应用；所述Pm024074基因具有如SEQIDNO.9所示的序列或如SEQIDNO.9所示的序列经一个或多个核苷酸的缺失、替换或插入得到的编码相同功能蛋白的核苷酸序列。10.Pm024074基因在垂枝梅花遗传育种中的应用；所述Pm024074基因具有如SEQIDNO.9所示的序列或如SEQIDNO.9所示的序列经一个或多个核苷酸的缺失、替换或插入得到的编码相同功能蛋白的核苷酸序列。2CN110819732A说明书1/9页梅花垂枝性状紧密连锁的纯合SNP分子标记及其检测方法与应用技术领域[0001]本发明涉及分子生物学及植物分子育种技术领域，具体涉及梅花垂枝性状紧密连锁的纯合SNP分子标记及其检测方法与应用。背景技术[0002]梅花(PrunusmumeSieb.etZucc.)隶属于蔷薇科(Rosaceae)李属(Prunus)，是中国的传统名花，具观赏价值和经济价值(陈俊愉.中国梅花品种图志[M].中国林业出版社,2010)。梅花品种丰富，色、香、味、型品种齐全，其中，垂枝梅是具有独特株型的梅花的九大品种群之一，因其别致的树姿兼具花色、花香等其它观赏性状而深受人们喜爱，在园林造景中具有重要的地位