一种茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115772579A(43)申请公布日2023.03.10(21)申请号202211509153.X(22)申请日2022.11.29(71)申请人广东省农业科学院蔬菜研究所地址510640广东省广州市天河区五山街省农业科学院内(72)发明人李涛宫超李植良孙保娟黎振兴游倩衡周(74)专利代理机构广东南北知识产权代理事务所(普通合伙)44918专利代理师肖湘漓(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)C12Q1/6858(2018.01)权利要求书1页说明书5页序列表（电子公布）附图2页(54)发明名称一种茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记及其应用(57)摘要本发明属于植物分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记及其应用。为挖掘调控茄子抗青枯病性状的SNP标记，本发明公开了一种茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记，所述SNP分子标记为SNP910，且核苷酸多态性为C/A。本发明首次公开了控制茄子抗青枯病性状的基因座位及与其紧密连锁的SNP分子标记，该分子标记能够准确、快速地鉴别出抗青枯病茄子品种和个体，可用于茄子抗青枯病种质资源的预测和筛选，也可以用于分子辅助育种创制抗青枯病茄子品种，具有重要的应用价值。CN115772579ACN115772579A权利要求书1/1页1.茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记SNP910在茄子分子辅助育种中的应用，其特征在于，所述应用包括茄子青枯病抗性早期预测和选育茄子抗青枯病品种，所述SNP分子标记SNP910具有如SEQNO.1所示的核苷酸，SEQNO.1所示序列的第22个碱基存在SNP变异位点C/A。2.权利要求1所述的茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记SNP910的扩增引物在茄子分子辅助育种中的应用，其特征在于，所述应用包括茄子青枯病抗性早期预测和选育茄子抗青枯病品种。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述扩增引物包括两条分别与C和A结合的正向引物以及一条反向引物。4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述扩增引物中，两条正向引物的5’端分别含有HEX基团和FAM基团。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述扩增引物包括如SEQNO.2和SEQNO.3所示的两条正向引物以及如SEQNO.4所示的反向引物。6.一种鉴定茄子青枯病抗性的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、提取待测茄子的基因组DNA；S2、以待测茄子提取的DNA为模板，利用茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记SNP910的扩增引物进行PCR扩增反应，所述扩增引物包括两条分别与C和A结合的正向引物以及一条反向引物，且两条正向引物的5’端分别含有HEX基团和FAM基团；S3、采用荧光检测平台对步骤S2的产物进行分型，若产物的荧光信号为HEX，则该样品为抗病，若产物的荧光信号为FAM，则该样品为感病。7.根据权利要求6所述的一种鉴定茄子青枯病抗性的方法，其特征在于，茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记SNP910的扩增引物与权利要求4相同。8.根据权利要求6所述的一种鉴定茄子青枯病抗性的方法，其特征在于，PCR扩增反应的体系为10μL，其中包含2×KASPmastermix5μL，反向引物0.4μL，正向引物各0.15μL，10‑100ng基因组DNA1μL，ddH2O为3.3μL。9.根据权利要求6所述的一种鉴定茄子青枯病抗性的方法，其特征在于，PCR扩增反应的程序为94℃、15min；94℃、20s，65‑57℃Touch‑down,‑0.88℃/cycles，10个循环；94℃、20s，57℃、1min，30个循环。10.根据权利要求6所述的一种鉴定茄子青枯病抗性的方法，其特征在于，步骤S3的分型方法为：使用TECANinfiniteM1000酶标仪读取荧光信号，并利用在线软件snpdecoder解析转换荧光信号，得到清晰直观的分型图。2CN115772579A说明书1/5页一种茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记及其应用技术领域[0001]本发明属于植物分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种茄子抗青枯病性状紧密连锁的SNP分子标记及其应用。背景技术[0002]由茄科雷尔氏菌(Ralstoniasolanacearum)侵染茄子引起的青枯病是茄子生产的毁灭性病害，危害严重时经济损失高达50‑60％，严重阻碍了茄子产业的发展。[0003]优良的种质资源是品种选育的基础，虽然国内外学者利用苗期接种鉴定和自然病圃对茄子种质资源开展抗青枯病筛选和评价研究发现多数茄子野生种及近缘野生种对青枯病具有较强的抗性，但这些茄子具有生长势强旺