检测结核分枝杆菌及治疗药物耐药相关的基因突变位点的引物和探针及试剂盒.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN113388690A(43)申请公布日2021.09.14(21)申请号202110752683.6C12Q1/6827(2018.01)(22)申请日2021.07.02C12Q1/04(2006.01)C12N15/11(2006.01)(71)申请人海南医学院地址571199海南省海口市龙华区城西学院路3号海南医学院(72)发明人尹飞飞黄艺杜江杜永国张丽媛刘昌江田秀颖王高玉彭箬岩胡小媛郎雨萌薛丽颖陈锦龙李天阳(74)专利代理机构北京集佳知识产权代理有限公司11227代理人潘颖(51)Int.Cl.C12Q1/689(2018.01)C12Q1/6837(2018.01)权利要求书4页说明书23页序列表11页(54)发明名称检测结核分枝杆菌及治疗药物耐药相关的基因突变位点的引物和探针及试剂盒(57)摘要本发明涉及医学检测技术领域，特别涉及一种检测结核分枝杆菌及耐药基因突变位点的引物和探针及试剂盒。该检测引物和探针包括：SEQIDNO：1至SEQIDNO：68所示的DNA序列。本发明基于Luminex液相芯片检测结核分枝杆菌耐药的类型，能够检测样本中是否存在结核分支杆菌，并覆盖异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、链霉素这4种一线抗结核药物，和二线抗结核药物福诺喹酮类药物，涵盖的突变位点全面，不仅检测速度快，完成一次检测仅需3.5小时，一次可以同时检测多达96个样本。可见，本发明简化了检测流程，缩短了实验周期，提高检测的准确性与灵敏性，更利于临床上的应用。CN113388690ACN113388690A权利要求书1/4页1.一种结核分枝杆菌及耐药基因突变位点的检测引物和探针，其特征在于，包括如下引物和探针：用于检测IS6110的引物组：SEQIDNO：1所示引物F、SEQIDNO：2所示引物R；用于检测16S的引物组：SEQIDNO：3所示引物F、SEQIDNO：4所示引物R；用于检测katG基因突变位点的引物组：SEQIDNO：5所示引物F、SEQIDNO：6所示引物R；用于检测inhA基因突变位点的引物组：SEQIDNO：7所示引物F、SEQIDNO：8所示引物R；用于检测rpoB基因突变位点的引物组：SEQIDNO：9所示引物F、SEQIDNO：10所示引物R；用于检测gyrA基因突变位点的引物组：SEQIDNO：11所示引物F、SEQIDNO：12所示引物R；用于检测rpsL基因突变位点的引物组：SEQIDNO：13所示引物F、SEQIDNO：14所示引物R；用于检测rrs基因突变位点的引物组：SEQIDNO：15所示引物F、SEQIDNO：16所示引物R；用于检测pncA基因突变位点的引物组：SEQIDNO：17所示引物F、SEQIDNO：18所示引物R；用于检测IS6110的探针：SEQIDNO：19所示；用于检测16S的探针：SEQIDNO：20所示；用于检测katG基因315位氨基酸突变位点的野生型探针katG‑315AGC：SEQIDNO：21所示；用于检测katG基因315位氨基酸突变位点的突变型探针katG‑315ACC：SEQIDNO：22所示；用于检测inhA基因15位氨基酸突变位点的野生型探针inhA‑‑15C：SEQIDNO：23所示；用于检测inhA基因15位氨基酸突变位点的突变型探针inhA‑‑15T：SEQIDNO：24所示；用于检测inhA基因8位氨基酸突变位点的野生型探针inhA‑‑8T：SEQIDNO：25所示；用于检测inhA基因8位氨基酸突变位点的探针突变型inhA‑‑8A：SEQIDNO：26所示；用于检测rpoB基因516位氨基酸突变位点的野生型探针rpoB‑516GAC：SEQIDNO：27所示；用于检测rpoB基因516位氨基酸突变位点的突变型探针rpoB‑516GTC：SEQIDNO：28所示；用于检测rpoB基因516位氨基酸突变位点的突变型探针rpoB‑516GGC：SEQIDNO：29所示；用于检测rpoB基因526位氨基酸突变位点的野生型探针rpoB‑526CAC：SEQIDNO：30所示；用于检测rpoB基因526位氨基酸突变位点的突变型探针rpoB‑526TAC：SEQIDNO：31所示；用于检测rpoB基因526位氨基酸突变位点的突变型探针rpoB‑526GAC：SEQIDNO：32所2CN113388690A权利要求书2/4页示；用于检测rpoB基因531位氨基酸突变位点的野生型探针rpoB‑531TCG：SEQIDNO：33所示；用于检测rpoB基因531位氨基酸突变位点的突变型探针rpoB‑531TTG：SEQIDNO：34所示；用于检测rpoB基因533位氨基酸突变位点的野生型探针r