检测结直肠癌和/或胃癌的生物标记物组合、试剂盒及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115927623A(43)申请公布日2023.04.07(21)申请号202211161022.7(22)申请日2022.09.22(71)申请人广州万孚生物技术股份有限公司地址510663广东省广州市黄埔区科学城荔枝山路8号(72)发明人刘慧张喆王敬羽张亚倩(74)专利代理机构广州广典知识产权代理事务所(普通合伙)44365专利代理师万志香(51)Int.Cl.C12Q1/6886(2018.01)C12Q1/686(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书6页说明书31页序列表（电子公布）附图9页(54)发明名称检测结直肠癌和/或胃癌的生物标记物组合、试剂盒及其应用(57)摘要本发明涉及一种检测结直肠癌和/或胃癌的生物标记物组合，包括ACVR2A基因的Chr2:148683685，包含8个连续A的同聚物重复的序列；还包括选自来源于DIDO1、LRIG2、SLC22A9、TGFBR2、CENPQ、MRE11、PSIP1基因的生物标记物中的至少两种。本发明筛选到多个与结直肠癌和胃癌相关的生物标记物的组合，其中特别是8位点组合在结直肠癌和胃癌中均有较高的检出率，检测一致性高达97％。本发明构建了检测效果良好的结直肠癌和胃癌的试剂盒，可用于临床上的结直肠癌和胃癌无创检测，以及预后监控。CN115927623ACN115927623A权利要求书1/6页1.一种检测结直肠癌和/或胃癌的生物标记物组合，其特征是，包括针对ACVR2A基因的起始于Chr2:148683685，包含8个连续A的同聚物重复的序列；还包括选自以下生物标记物中的至少两种或至少三种：针对TGFBR2基因的起始于Chr3:30691871，包含10个连续A的同聚物重复的序列；针对SLC22A9基因的起始于Chr11:63149670，包含11个连续A的同聚物重复的序列；针对DIDO1基因的起始于Chr20:61536691，包含11个连续A的同聚物重复的序列；针对LRIG2基因的起始于Chr1:113667282，包含11个连续T的同聚物重复的序列；针对MRE11基因的起始于Chr11:94212930，包含11个连续A的同聚物重复的序列；针对CENPQ基因的起始于Chr6:49459994，包含10个连续T的同聚物重复的序列；针对PSIP1基因的起始于Chr9:15472611，包含11个连续A的同聚物重复的序列；针对ZNF2基因的起始于Chr2:95848209，包含11个连续T的同聚物重复的序列；针对PIM1基因的起始于Chr6:37143155，包含11个连续T的同聚物重复的序列；针对RPL22基因的起始于Chr1:6257784，包含8个连续T的同聚物重复的序列；针对SULF2基因的起始于Chr20:46286320，包含10个连续A的同聚物重复的序列；针对KMT2C基因的起始于Chr7:151832596，包含11个连续T的同聚物重复的序列；针对SEC31A基因的并起始于Chr4:83785564，包含9个连续T的同聚物重复的序列。2.根据权利要求1所述检测结直肠癌和/或胃癌的生物标记物组合，其特征是，所述生物标记组合是包括针对ACVR2A基因的起始于Chr2:148683685，包含8个连续A的同聚物重复的序列、针对DIDO1基因的起始于CHR20:61536691，包含11个连续A的同聚物重复的序列和针对TGFBR2基因的起始于Chr3:30691871，包含10个连续A的同聚物重复的序列的组合；或所述生物标记组合是包括针对ACVR2A基因的起始于Chr2:148683685，包含8个连续A的同聚物重复的序列、针对DIDO1基因的起始于CHR20:61536691，包含11个连续A的同聚物重复的序列和SLC22A9基因的起始于Chr11:63149670，包含11个连续A的同聚物重复的序列的组合。3.根据权利要求1所述检测结直肠癌和/或胃癌的生物标记物组合，其特征是，包括针对ACVR2A基因的所述生物标记物，以及选自针对PSIP1基因、SLC22A9基因、KMT2C基因、PIM1基因、ZNF2基因、DIDO1基因、LRIG2基因、RPL22基因、MRE11基因、TGFBR2基因、SEC31A基因、SULF2基因、CENPQ基因中所述生物标记物中的至少三种；优选地，所述生物标记组合是包括针对ACVR2A基因的起始于Chr2:148683685，包含8个连续A的同聚物重复的序列、针对DIDO1基因的起始于CHR20:61536691，包含11个连续A的同聚物重复的序列、针对LRIG2基因的起始于Chr1:113667282，包含11个连续T的同聚物重复的序列和针对SLC