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本公开尤其提供了用于检测受试者中的AAV构建体或其片段的脱落的引物和探针。在一些实施方案中,选择引物以生成扩增子,所述扩增子包含(i)第一链,其包含:(1)对应于所述正向引物的核苷酸序列,和(2)对应于AAV构建体或其片段的部分的核苷酸序列,(ii)第二链,其包含:(1)所述反向引物的核苷酸序列,和(2)与AAV构建体或其片段的部分互补的核苷酸序列,或(iii)其组合,其中AAV构建体或其片段的部分包含跨越调节元件和目标治疗基因之间的连接的核苷酸序列。