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对细微组织结构(例如在非神经、非骨的组织或器官中的那些结构)的调查最好在完整的组织中进行。本文描述了用于使组织透明化以便随后进行三维分析的组合物和方法。作为组织透明化组合物的本发明组合物由四个核心组分构成:(1)均质剂,如N?甲基葡糖胺、尿素、硫脲、胍、氯化胍、高氯酸锂、乙二胺及其衍生物;(2)水溶性调节剂,如碘海醇、硫代硫酸钠、聚乙二醇及其衍生物;(3)脂溶性调节剂,如2,2?硫代二乙醇、丙二醇及其衍生物;以及(4)硼酸盐化合物,如硼酸、四硼酸、四硼酸二钠及其衍生物。公开的组织透明化组合物特别适用于非神经、非骨的组织或器官。这些组织或器官可以是新鲜的、归档的或从石蜡包埋的组织恢复的。