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本发明公开了一种小儿感冒退热糖浆指纹图谱的建立方法及其指纹图谱。其中,该建立方法包括以下步骤:1)制备供试品溶液和参照物溶液;2)采用HPLC对所述供试品溶液和所述参照物溶液分别进行进样分析,得到供试品溶液HPLC指纹图谱;3)将所述供试品溶液HPLC指纹图谱数据导入中药指纹图谱相似度评价系统2012版中,以其中1个供试品溶液指纹图谱为参照图谱,用平均数法生成小儿感冒退热糖浆指纹图谱对照图谱。应用本发明的技术方案,小儿感冒退热糖浆的指纹特征图谱生成18个共有峰,能够提供丰富的鉴别信息,较为全面地反映小儿感冒退热糖浆中所含化学成分的种类与数量,进而对其质量进行整体描述和评价。