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本发明公开了一种石斛总寡糖和/或石斛寡糖的制备方法,该方法包括以下步骤:(1)称取适量的石斛药材,加入水在一定温度下加热回流提取,将过滤后的提取液合并,减压浓缩至一定体积并离心,弃去药渣,上清液加入乙醇沉淀,充分搅拌均匀后静置过夜,离心,收集上清液合并后减压浓缩至无乙醇,冷冻干燥得到石斛总寡糖;以及可选地(2)对该石斛总寡糖通过活性炭?硅藻土柱进行柱层析以及通过ODS?AQ制备柱进行柱层析从而分离纯化得到该石斛寡糖。该工艺简单、方便、无污染、且石斛总寡糖和/或石斛寡糖得率和纯度高。