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本发明涉及一种钨冶炼过程中钨、钼分离除杂的方法,包括以下步骤:(1)调节含钼钨酸盐溶液的pH值至5~10,得到溶液A;(2)向溶液A中加入硫酸盐还原菌菌种及碳源,进行硫化反应,得到溶液B;(3)调节溶液B至酸性,保温反应生成沉淀,滤除沉淀,完成钨、钼分离除杂。本发明利用生物转化技术与化学沉淀相结合,先利用硫酸盐还原菌将硫酸根离子还原成硫离子,硫离子再与钨酸盐溶液中的钼酸根离子硫代化反应,形成硫代钼酸盐,硫化过程完全后,调节pH,使MoS42?转化为MoS3沉淀,从而达到高效除钼的目的,提供了一种全新钨冶炼过程中钨、钼高效分离技术,能够有效去除钨酸钠溶液中94%以上的钼。