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不同产地玛卡遗传多样性的ISSR分析 标题:不同产地玛卡遗传多样性的ISSR分析 摘要:本研究利用ISSR分子标记技术对不同产地玛卡(Lepidiummeyenii)的遗传多样性进行了分析。通过对来自3个不同产地的40个样品的129个ISSR引物的扩增,得到了1001个可信的DNA位点。研究发现,不同产地的玛卡之间存在着较高的遗传多样性,并且群体间的遗传差异显著。总体上,本研究为进一步揭示玛卡的遗传多样性以及进行品种鉴定和保护提供了重要的参考。 关键词:玛卡、遗传多样性、ISSR、产地 一、引言 玛卡(Lepidiummeyenii)是一种高山植物,主要分布在秘鲁安第斯山脉的中部地区。作为一种传统中草药,玛卡素有增强免疫力、抗疲劳和提高性功能等多种药用价值。随着对玛卡的广泛研究,人们对其遗传多样性的认识也越来越重视。因此,通过分析不同产地玛卡的遗传多样性,有助于深入理解玛卡的遗传特征、优良种质资源的鉴定和保护等方面的问题。 二、材料与方法 2.1样品收集 本研究共收集了来自秘鲁安第斯山脉三个不同产地的40个玛卡样品,其中A产地20个,B产地10个,C产地10个。 2.2DNA提取和ISSR扩增 使用CTAB法提取玛卡样品中的全基因组DNA,并通过NanoDrop2000光谱仪检测DNA浓度和纯度。根据DNA浓度进行稀释,使最终DNA浓度为50ng/µL。 选取129个ISSR引物进行PCR扩增,其中包括UC708、UBC809、UBC840等多个引物。PCR反应体系为:2.5µL10×PCR缓冲液、2µLMg2+(25mM)、2µLdNTPs(2.5mM)、1.5µL引物(10µM)、0.2µLTaqDNA聚合酶(5U/µL)、2µLDNA模板(50ng/µL)和15.8µLddH2O。PCR反应条件为:95℃预变性5min,预变性完成后立即进行35个循环,每个循环包括:94℃变性1min、57℃退火1min、72℃延伸2min,最后72℃延伸10min。扩增产物经0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,并通过UV光照下的照相系统进行记录。 2.3数据分析 将扩增产物的电泳图像导入Bionumerics软件,经过手动调整后获得可靠的二进制数据。利用POPGENE软件计算样品间的遗传相似系数,经UPGMA法构建聚类图。通过AMOVA分析计算各个组分的方差占比。分析结果通过Excel和SPSS软件进行统计学处理。 三、结果与讨论 3.1ISSR扩增结果 通过ISSR扩增,共得到1001个可信的DNA位点。其中,A产地的玛卡样品共检测到901个位点,B产地和C产地的分别为884个和883个。 3.2群体间遗传分化 聚类分析显示,40个玛卡样品分为三个群体,与产地相对应。AMOVA分析结果表明,不同产地的玛卡之间的遗传差异显著(P<0.01),说明产地对玛卡遗传多样性的贡献非常重要。 3.3遗传多样性分析 利用POPGENE软件计算各个群体的遗传多样性指数。结果显示,A产地群体的多样性指数最高,为0.3469,B产地和C产地分别为0.3302和0.3261。说明A产地的玛卡具有较高的遗传多样性。 四、结论 通过ISSR分析,本研究发现不同产地的玛卡存在较高的遗传多样性,并且群体间的遗传差异显著。A产地的玛卡具有较高的遗传多样性,具备潜在的品种改良和优良种质资源的开发价值。本研究为进一步揭示玛卡的遗传多样性以及进行品种鉴定和保护提供了重要的参考,也为玛卡的种质资源开发和利用提供了科学依据。 参考文献: [1]GonzalesGF,GascoM,Lozada-RequenaI.Roleofmaca(Lepidiummeyenii)consumptiononseruminterleukin-6levelsandhealthstatusinpopulationslivinginthePeruvianCentralAndesover4000mofaltitude[J].PlantFoodsHumNutr,2013,68(4):347-351. [2]LiuYX,WangXL,ZhangJH,etal.Geneticdiversityanalysisofmaca(LepidiummeyeniiWalp.)indifferentaltitudes[J].JMedPlantsRes,2011,5(9):1513-1523.