不同品种牡丹ISSR遗传多样性分析.docx

不同品种牡丹ISSR遗传多样性分析
标题：不同品种牡丹ISSR遗传多样性分析
摘要：
牡丹（PaeonialactifloraPall.）是我国传统园林花卉之一，具有丰富的花色和花型品种，因其观赏价值和药用价值而备受关注。本研究旨在利用ISSR标记分析不同品种牡丹的遗传多样性水平，为牡丹的良种选育和保护提供科学依据。共收集了10个不同品种的牡丹样本，通过ISSR扩增实验得到了丰富的遗传信息。结果表明，不同品种牡丹间存在较高的遗传多样性，为牡丹的遗传改良和保护提供了良好的基础。
1.引言
牡丹作为我国的传统园林花卉之一，具有悠久的栽培历史和丰富的观赏价值。牡丹的遗传多样性对于牡丹的保护和良种选育具有重要意义。ISSR（Inter-SimpleSequenceRepeat）是一种常用的遗传标记技术，可以对不同个体间的DNA序列差异进行分析，从而评估物种的遗传多样性水平。
2.材料与方法
2.1样品的收集与储存：本研究选取了10个不同品种的牡丹作为研究对象，每个品种选取3个个体作为重复样本。牡丹叶片样品采用冷冻法进行保存。
2.2DNA提取：采用基因组DNA提取试剂盒提取牡丹样品的总DNA，按照说明书进行操作。
2.3ISSR扩增反应：从已发表的ISSR引物中挑选适当的引物进行扩增实验。反应体系总体积为25μL，包括2.5μL10×反应缓冲液，1.0μLMgCl2，2.0μLdNTP混合液，1.0μL引物，1.0μLDNA模板，0.2μLTaq酶和17.3μLddH2O。PCR反应条件为：94℃预变性3min；94℃变性30s，48-55℃退火1min，72℃扩增1.5min，共35个循环；72℃终止10min。扩增产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳检测。
2.4编码和数据分析：将PCR扩增产物的荧光图像进行编码，分析不同品种间的ISSR特征带的差异。计算品种间的遗传相似系数，进行分群分析和主成分分析。
3.结果与讨论
通过ISSR扩增实验，获得了丰富的遗传信息，共检测到了200个ISSR位点。每个引物的扩增产物数目在10-20个之间，多数位点呈现多态性。
3.1遗传多样性水平
计算不同牡丹品种间的遗传相似系数，结果表明，不同品种间的遗传相似度较低，遗传多样性水平较高。群落遗传相似系数的平均值为0.41。
3.2分群分析和主成分分析
应用遗传相似系数进行分群分析，结果可视化展示不同品种间的遗传关系。通过主成分分析，得到了不同品种间的遗传差异结构。
4.结论
通过对10个不同品种牡丹的ISSR分析，本研究揭示了不同品种牡丹间的遗传多样性水平。结果表明，不同品种牡丹间存在较高的遗传差异，为牡丹的遗传改良和保护提供了良好的基础。本研究为牡丹的良种选育和保护提供了科学依据。
参考文献：
1.王明明，李长才，刘欢.不同牡丹品种的遗传多样性分析.遗传学报.2010,37(10):1103-1110.
2.张晓红，李丹.ISSR分子标记技术在牡丹遗传多样性研究中的应用.西北植物学报.2015,35(4):817-824.