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第二章蛋白质化学肽是氨基酸的线性聚合物,也常称肽链; 蛋白质是由一条或多条多肽链以特殊方式结合而成的生物大分子。 蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将相对分子质量为6000以上的多肽称为蛋白质。 蛋白质相对分子质量变化范围很大,人为规定从大约6000到1000000甚至更大。一、基本问题---肽 一个氨基酸的氨基与另一个氨基酸的羧基之间失水形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物称为肽。1.多肽2、肽单位肽单位的特性蛋白质的一级结构是指由不同种类、数量的氨基酸,通过肽键而构成的排列顺序。肽链的氨基酸顺序; 组成蛋白质的多肽链数目; 多肽链内或链间二硫键的数目和位置。 其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。二级结构是指多肽链的主链骨架中若干肽单位,各自沿一定的轴盘旋或折迭,并以氢键为主要的次级键而形成有规则的构象,如α螺旋、β折迭和β转角等。 它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。 不涉及侧链部分的构象。 主要有-螺旋、-折叠、-转角。1.α-螺旋:(helix)(1)多个肽键平面通过α-碳原子旋转,紧密盘曲成螺旋状,有左、右手螺旋之分,常见右手螺旋; (2)主链呈螺旋上升,每3.6个氨基酸残基上升一圈,相当于0.54nm; (3)每一个氨基酸残基中的NH和前面相隔三个残基的C=O之间形成氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行; (4)氨基酸侧链R在螺旋外侧,其形状、大小及电荷影响α-螺旋的形成。2、-折叠-折叠的特点3、β-转角的结构特征4)无规卷曲(randomcoil)超二级结构:在多肽链内顺序上相互邻近的二级结构常常在空间折叠中靠近,彼此相互作用,形成规则的二级结构聚集体。已知有3种基本形式:αα、βαβ、ββ。结构域:在多肽链上由二级结构元件或超二级结构形成的相对独立的紧密球状实体,是三级结构的局部折叠区。较小的球状蛋白质或亚基是单结构域,而较大的球状蛋白质或亚基是多结构域。 结构域之间常形成裂隙,比较松散,往往是蛋白质优先被水解的部位。酶的活性中心往往位于两个结构域的界面上。 结构域之间由“铰链区”相连,使分子构象有一定的柔性,通过结构域之间的相对运动,使蛋白质分子实现一定的生物功能。 在蛋白质分子内,结构域可作为结构单位进行相对独立的运动,水解出来后仍能维持稳定的结构,甚至保留某些生物活性。四、蛋白质的三级结构五、蛋白质的四级结构血红蛋白(hemoglobin)的四级结构维持蛋白质结构稳定的因素第三节蛋白质的性质二、蛋白质的两性离解和等电点三、蛋白质的胶体性质四、蛋白质的沉淀作用2.不可逆沉淀 在强烈沉淀条件下,不仅破坏了蛋白质胶体溶液的稳定性,而且也破坏了蛋白质的结构和性质,产生的蛋白质沉淀不可能再重新溶解于水。 加热沉淀、强酸碱沉淀、重金属盐沉淀和生物碱沉淀等都属于不可逆沉淀。蛋白质的性质与其结构密切相关。某些物理或化学因素能够破坏蛋白质的结构状态,引起蛋白质理化性质改变并导致其生理活性丧失,这种现象称为蛋白质的变性。蛋白质的变性通常都伴随着不可逆沉淀。 蛋白质的变性不涉及到一级结构的变化,只是二、三、四级结构发生变化。 引起变性的主要因素:物理因素:热、紫外光、激烈搅拌、高压等化学因素:强酸、强碱、有机溶剂、脲、胍等。 六、蛋白质的紫外吸收七、蛋白质的颜色反应第四节蛋白质的分类蛋白质思考题: