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吉林农大动物生化第4章核酸化学一、核酸(nucleicacid)的含义二、核酸的发现及研究进展三、核酸的分类四、核酸的分布四、核酸的分布复制转录翻译 DNADNARNA蛋白质五、主要生物学功能第二节核酸的化学组成 ChemicalComponentandofNucleicAcid一、元素组成戊糖1、嘌呤(purine)修饰嘌呤(稀有嘌呤)修饰嘌呤(稀有嘌呤)2、嘧啶(pyrimidine)稀有嘧啶尿嘧啶(uracil,U)腺嘌呤(二)戊糖修饰糖核糖核苷(核苷):A、G、U、C 脱氧核糖核苷(脱氧核苷):dA、dG、dT、dC胸苷(dT)β1’核糖核苷酸(NMP):AMP,GMP,UMP,CMP 脱氧核苷酸(dNMP):dAMP,dGMP,dTMP,dCMP3、结构一磷酸核苷(NMP)一磷酸脱氧核苷 (dNMP)4、体内重要的游离核苷酸及其衍生物环核苷酸的分子结构第三节核酸的分子结构 DimensionalStructureofNucleicAcid5´端二、核酸的一级结构(二)DNA的一级结构DNA来源三、二级结构(1)DNA双螺旋(B型)结构③所有的碱基平面几乎与螺旋轴垂直。所有的糖环平 面与螺旋轴平行。相邻两个碱基平面间的距离为0.34nm,夹角为36℃,所以每10对碱基对旋转一周,螺距为3.4nm。碱基互补配对B—DNA:相对湿度92%1979年,Rice发现人工合成的CGCGCG 序列为左手双螺旋,且磷酸二酯键呈 锯齿状(Zigzag),故称Z型DNA。(二)RNAtRNA:三叶草结构rRNA:四、三级结构绝大多数原核生物的DNA 都是共价封闭的环状双 螺旋。如果再进一步盘 绕则形成麻花状的超螺 旋三级结构。3、DNA在真核生物细胞核内的组装第四节RNA的分子结构一、RNA的碱基组成 RNA由四种主要碱基A、G、C、U组成。 一般不含T。还含有少量稀有碱基。如假尿嘧 啶核苷及甲基化碱基等。但RNA分子中的碱基 没有A=U、G=C的比例关系。RNA又可根据分子大小和生物学功能不同,分为:RNA的种类、分布、功能RNA分子主要由AMP,GMP,CMP,UMP四种 核糖核苷酸组成。RNA的一级结构就是指 RNA分子中核糖核苷酸的排列顺序及连接 方式。 1、真核生物mRNA一级结构特点帽子结构2、tRNA的一级结构特点 含10~20%稀有碱基,如DHU 3´末端为—CCA-OH 5´末端大多数为G 具有TCN,N二甲基鸟嘌呤三、RNA的二级结构*tRNA的二级结构 ——三叶草形 氨基酸臂 DHU环 反密码环 额外环 TΨC环氨基酸臂一、核酸的一般理化性质 1、大分子性质:核酸的分子量很大,一般为106~1010。核酸溶液粘度大。 2、溶解性:核酸微溶于水,不溶于有机溶剂。 3、核酸的酸碱性质 核酸中的磷酸和碱基均能发生两性解离。核酸是两性电解质。具有酸性。 DNA等电点4—4.5;RNA等电点2—2.5二、颜色反应二、核酸的紫外吸收 碱基、核苷、核苷酸和核酸在240~290nm的紫外波段有强烈的光吸收,最大吸收峰为260nm。 λmax=260nm1.DNA或RNA的定量 OD260=1.0相当于50μg/ml双链DNA 40μg/ml单链DNA(或RNA) 20μg/ml寡核苷酸 2.判断核酸样品的纯度 DNA纯品:OD260/OD280=1.8RNA纯品:OD260/OD280=2.0若溶液中含有杂蛋白或苯酚,则A260/A280比值明显降低。 3、判断DNA是否变性 在DNA的变性过程中,摩尔吸光系数增大(增色效应) 在DNA的复性过程中,摩尔吸光系数减小(减色效应(一)变性(denaturation)▲实质破坏DNA的空间结构 例:变性引起紫外吸收值的改变DNA的热变性Tm:变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融解温度(meltingtemperature,Tm)。其大小与G+C含量成正比。影响DNA的Tm值的因素②G-C含量与Tm值成正比。 测定Tm,可推知G-C含量。 G-C%=(Tm-69.3)×2.44③介质中离子强度 离子强度高,Tm高。★变性因素: 热变性 酸碱变性(pH小于4或大于11) 变性剂(尿素、盐酸胍、甲醛、酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮等。) ★变性后的理化性质: OD260增高 粘度下降 比旋度下降 浮力密度升高 酸碱滴定曲线改变 生物活性丧失(二)复性(renaturation)DNA的复性★复性机制:10-20bp成拉链 ★热变性DNA在缓慢冷却时可以复性,快速冷却不能复性。 ★DNA片段越大,复性越慢; ★DNA浓度越大,复性越快。 在DNA变性后的复性过程中,如果将不同种类的DNA单链分