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第2章蛋白质2.1蛋白质的分类蛋白质是生物体内种类最多,结构最复杂,功能多样化的大分子。 1、根据分子形状分类 球状蛋白 肌纤维状蛋白 膜蛋白 2、根据分子组成分类简单蛋白(清蛋白、球蛋白、谷蛋白、精蛋白、组蛋白等) 结合蛋白(核蛋白、糖蛋白、脂蛋白、色蛋白、磷蛋白) 3、根据功能分 酶 调节蛋白(如激素) 贮存蛋白 转动蛋白 运动蛋白2.2蛋白质的组成单位-氨基酸一、氨基酸(aminoacids)简写AA——蛋白质的构件分子(二)氨基酸的结构通式氨基酸的结构通式----C-C-C-C-COOH δγβα ----C-C-C-C(NH2)-COOHα-氨基酸 ----C-C-C(NH2)-C-COOHβ-氨基酸 ----C-C(NH2)-C-C-COOHγ-氨基酸10脯氨酸是α-亚氨基酸2.2.2氨基酸的分类按R基性质分类:2、非极性芳香族族R基aa3、不带电荷的极性R基aa4、带正电荷的R基aa5、带负电荷的R基aa按R基的化学结构分类:(2)含羟基或硫aa(3)酸性aa及其酰胺(4)碱性aa2、芳香族aa3、杂环aa2425262728293031赖氨酸 鸟氨酸 瓜氨酸 2.2.3氨基酸的理化性质38H3N—CH—COOH4041(二)氨基酸的等电点根据氨基酸PI值和溶液PH值,很容易判断氨基酸分子的带电情况: 当PH=PI时,在电场中不移动 当PH>PI时,氨基酸分子带负电荷,在电场中向正极移动。 当PH<PI,氨基酸分子带正电荷,在电场中向负极移动。 PI的利用甘氨酸滴定曲线4546对于侧链含有可解离基团的AA pI取决于两性离子两边pK’值的算术平均值 酸性AA:pI=(pK’1+pK’R-COO-)/2 碱性AA:pI=(pK’2+pK’R-NH2)/2 2.2.3.2氨基酸的化学(一)α-氨基参加的反应 NH2OH RCHCOOH+HNO2RCHCOOH+H2O+N2 范斯莱克法测氨基氮(体积)的基础。 N2中的1/2为氨基氮。 51—N=C=S+N—CH—COOHNO24、形成Schiff’s(希夫)碱 R’COOHR’COO C=O+H2NCHC=NCH HRHR5.脱氨基反应 在生物体内经AA氧化酶催化 即脱去α-氨基而转变为酮酸。(二)α-羧基参加的反应(2)成酯NH2干燥,HClRCHCOOH+C2H5OH回流RCHCOOC2H5+H2O保护氨基活化羧基3.脱羧基反应 NH2脱羧酶 R—CH-COOH R-CH2-NH2+CO2 (三)α-羧基和α-氨基都参加的反应61弱酸加热(四)侧链R基参加的反应Tyr酚基在3和5位上易发生亲电取代反应, 如碘化和硝化Arg侧链胍基与环己二酮生成缩合物6667与二硫硝基苯甲酸发生硫醇-二硫化物交换Cys的巯基不稳定,易被氧化成二硫键 巯基在有痕量的金属离子如: Cu2+,Fe2+,Co2+或Mn2+时,易被氧化五、AA的光学活性和光谱性质α-氨基酸的立体结构D-甘油醛L-甘油醛 平面偏振光的偏振面发生旋转73747576氨基酸的光学活性和光谱性质:(二)氨基酸的光谱性质Trp280nm Tyr275nm Phe257nm溶液的吸光度A定义为:A=lg(I0/I)=cL 其中A:吸光度;I0:入射光强度;I:透射光强度。 :摩尔吸收系数(消光系数)(L/(cm·mol)); c:溶液浓度(mol/L); L:测试杯的光程(cm)六、氨基酸混合物的分析分离{按两相所处状态分:(二)分配柱层析87(三)纸层析(五)离子交换层析本章重点:氨基酸的基本知识2.3肽2.3.1肽及肽键93由两个AA组成的肽称为二肽。 由多个AA组成的肽则称为多肽。 组成多肽的AA单元称为氨基酸残基。多肽链中AA残基按一定顺序排列:氨基酸顺序 含游离-氨基的一端:氨基端或N-端 含游离-羧基的一端:羧基端或C-端 AA顺序是从N-端开始以C-端氨基酸残基为终点 如上述五肽:Ser-Val-Tyr-Asp-Gln肽键的结构①肽键中C-N键有部分 双键性质 ——不能自由旋转 ②组成肽键原子处于 同一平面(肽平面) ③键长及键角一定 ④大多数情况以反式 结构存在共价主链2.3.2、生物活性肽的功能100101