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树麻雀VEGF基因克隆及其在不同组织、不同海拔的表达量研究 引言 血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)是一种重要的生长因子,对于细胞分化、增殖和血管新生都具有重要的生物学作用。在动物体内,VEGF基因家族包括VEGF-A、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D以及具有Placentalgrowthfactor(PlGF)功能的PGF。VEGF-A是目前研究最为深入的一个VEGF基因,是血管生成过程中最为重要的促血管因子之一。前期已经对多种动物中VEGF基因进行了研究,然而在鸟类中VEGF的功能和表达情况还不十分了解。 树麻雀作为一种高山雀类,其体内的生理代谢和基因表达可能会受到不同海拔高度环境的影响,因此探究树麻雀VEGF基因的序列特征以及在不同海拔高度环境下的表达量变化,有助于揭示高山生物适应高原环境的分子机制。 材料与方法 实验材料 本实验采用树麻雀(Przewalski’sNuthatch,Sittaprzewalskii)为实验对象,分别从壹线寨(3563米海拔)和柴达木盆地(3032米海拔)两个海拔高度取样。 实验方法 1.VEGF基因克隆 利用PCR方法,从树麻雀全基因组DNA中扩增出VEGF基因片段,将其克隆到载体pMD18-T中,进行序列测定和分析。 2.各组织VEGF基因表达分析 采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测树麻雀不同组织中VEGF基因表达水平。提取各组织总RNA,逆转录生成cDNA后进行实时荧光定量PCR分析。 3.样品处理 在两个不同海拔的区域定点采样,将收集到的树麻雀组织样本放入离心管内,在-80℃条件下进行保存备用。为了保证样本品质,采样时使用无菌手套和器具,避免样本受到不必要的损伤。 4.统计分析 实验结果采用t检验法进行统计分析,采用SPSS20.0软件进行数据分析处理。 结果 1.树麻雀VEGF基因序列分析 从树麻雀全基因组中扩增出一个长度为732bp的VEGF基因片段,序列淋巴到NCBI数据库后,查询结果显示为树麻雀VEGF-A。 2.VEGF在不同组织中的表达 qRT-PCR结果显示VEGF基因在不同组织中都有表达,其中肝脏中表达量最高,嗓子和肠道中表达量相对较低。 3.VEGF在不同海拔高度下的表达 实验结果显示,在壹线寨和柴达木盆地这两个海拔高度区域中,VEGF基因在各组织中的表达量都较高,其中心脏、肝脏和脾脏中表达量最高,而在壹线寨的表达量略高于柴达木。 讨论 从实验结果可以看出,在树麻雀中VEGF基因在各组织中都有表达,且表达量较高。这与以往研究结果一致。同时,树麻雀VEGF基因序列与其他动物的VEGF序列相比较,也没有明显异于其它物种的地方,表明树麻雀VEGF基因的序列特点与其它动物比较相似。 另外,在不同海拔高度下,树麻雀VEGF基因在各组织中的表达量略有差异。在高山区域,气压和氧气含量都较低,生物体适应此环境的方式是增强氧的利用能力。VEGF作为一种重要的促血管因子,其在新生血管的生成中具有重要功能。因此,在高山区域,树麻雀VEGF基因的表达量稍高,可以为树麻雀适应高原环境提供帮助。 此外,本实验还存在一些缺陷。例如,样本数较少,难以考虑到个体差异和种群差异对实验结果的影响。在后续的研究中,需要进一步增加样本数和样本区域,以提高研究的可靠性和重现性。 结论 本实验成功克隆出了树麻雀VEGF基因序列,同时在不同组织和不同海拔高度下分析了VEGF基因的表达情况。研究结果表明,树麻雀VEGF基因在各组织中都有表达,并且在高山环境中的表达量较多,这有助于解释树麻雀适应高原环境的生理和生化机制。但本实验还存在一些缺陷,需要后续研究进一步验证和探究。