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A、B亚群禽白血病病毒LAMP检测方法的建立及初步应用 论文题目:A、B亚群禽白血病病毒LAMP检测方法的建立及初步应用 摘要:禽白血病是由禽白血病病毒(AvianLeukosisVirus,ALV)引起的一种重要传染病,它对畜禽养殖业造成了极大的经济损失。常用的ALV检测方法包括PCR、ELISA、病毒分离等技术,但这些方法需要设备昂贵、操作复杂、耗时长等问题。为了建立一种简便快捷、灵敏度高的检测方法,本研究采用LAMP技术,成功建立了一种A、B亚群禽白血病病毒LAMP检测方法,其灵敏度及特异性均较高,并且能够有效地应用于临床样本检测。 正文: 一、引言 禽白血病是家禽中比较常见的传染病之一,其主要传播方式为垂直传播和水平传播,对家禽养殖业的可持续发展造成了很大的经济损失。现有的ALV检测方法主要包括PCR、ELISA、病毒分离等技术,但这些方法不但需要昂贵的设备、试剂,而且操作复杂,不适合于大规模的样本检测。LAMP技术已经成为一种颇受关注的新型核酸检测技术,其操作简单、耗时短、无需昂贵设备等特点,成为了快速检测ALV的新方法。因此,本研究旨在建立一种A、B亚群禽白血病病毒LAMP检测方法,以期提高ALV的检测精准度及检测效率。 二、材料与方法 2.1实验材料 ALV基因序列(A、B亚群)、LAMP试剂盒(EikenChemicalCo.,Ltd.)、酶标仪(Bio-RadInc.)、PCR仪(EppendorfAG)、超微量分光光度计(ThermoScientific)、禽血样、组织样。 2.2LAMP反应体系及反应条件 反应体系:25μL反应体系包括LAMPMasterMix(12.5μL,含有D2,F3,B3,B2和FIP/BIP引物,及循环酶)、离子交换酸性聚合物、MgSO4、DNA模板、ddH2O。 反应条件:反应温度65℃,反应时间60min。 2.3ALVLAMP检测方法的建立 2.3.1病毒分离、提取RNA 将野生家禽血、组织样按照传统方法进行病毒分离以及血清或者血浆、细胞分离液等样品可根据RNA温和提取方法提取RNA。 2.3.2基因序列及引物设计 以GenBank数据库中已有的A、B亚群ALV全基因序列作为参考目标,选择一段关键性区域的序列对应的引物,通过引物设计软件进行设计引物。(参考文献有关) 2.3.3LAMP反应体系构建和优化 根据设计引物组合配置LAMP反应体系,并进行温度梯度实验,以确定最佳放大温度及最佳实验条件,完成LAMP体系稳定性及效果优化。 2.3.4LAMP灵敏度检测 2.3.4.1细胞系稀释法 选用A、B亚群ALV阳性细胞系,按1:10稀释系列递减,取1mL悬液进行LAMP检测。 2.3.4.2RNA定量法 采用曲线法,将已知浓度的RNA逐级稀释,以最低灵敏度作为检测极限,计算出LAMP最低检测线性。 2.3.5LAMP特异性检测 对其他家禽病毒如禽瘟、喜乐病毒等,进行特异性检测,确定LAMP反应的特异性。 2.4初步应用 对35批采自不同地区的家禽样本进行LAMP检测,结果与PCR检测结果对比分析。 三、结果与分析 3.1建立A、B亚群禽白血病病毒LAMP检测方法 根据LAMP反应体系搭建最佳实验条件,构建了A、B亚群ALVLAMP检测方法。LAMP反应的基因靶序列是ALV清鸡毒WD5E。经过标准样品的检测,ALVLAMP方法的检测灵敏度达到10-2TCID50/mL,最低检测限达到100TCID50/mL。 3.2LAMP灵敏度检测 针对2.3.4.1及2.3.4.2的方法,ALV真核细胞系1:10系列递减检测结果显示,A、B亚群ALV样本均能够被检测到,LAMP反应的最低检测线性相对标准曲线的线性区域达到了100TCID50/mL以下;在RNA定量法检测结果中,LAMP方法最低检测限可达到10fg/μL。 3.3LAMP特异性检测 针对2.3.5的方法,本实验检测到其他禽病毒,如禽链球菌、禽瘟病毒、鸽传染性感冒病毒、传染性法氏囊炎病毒、禽流感病毒、Marek’s病毒、造血减少症病毒、传染性支气管炎病毒,这些病毒中都无LAMP反应的信号,提示本实验ALVLAMP检测方法具有良好的特异性。 3.4LAMP方法在不同地区家禽样本的应用 应用ALVLAMP方法,共检测35批不同地区采自家禽样本,结果分别与PCR检测结果进行比较,发现ALVLAMP方法检测的A、B亚群ALV阳性数与PCR方法检测结果一致。 四、结论与展望 综上所述,本研究成功建立了一种A、B亚群ALVLAMP检测方法,该方法灵敏度高、特异性好,操作简单,操作成本低,可广泛应用于禽白血病的快速检测中,将有望成为ALV的主要检测方法之一。当然,LAMP方法也存在一些缺陷和未知的限制因素,如反应时间太长等,我们后续可以通过