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F亚群禽白血病病毒SYBRGreenⅠ荧光定量PCR检测方法的建立 引言 亚群禽白血病是一种由禽白血病病毒感染引起的疾病,主要发生在家禽和饲养中的其他禽鸟,如鸽子、鹌鹑等。该病在禽群中的发病率高,很容易引起禽类的死亡,严重影响畜牧业和家禽养殖业的发展。因此,建立一种快速、准确、可靠的检测方法非常重要。目前,PCR技术作为一种特异性高、灵敏度高、快速、可靠的检测方法逐渐受到广泛关注。 本研究旨在建立一种基于SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR技术检测亚群禽白血病病毒的方法,并对其灵敏度、特异性和稳定性进行评价,为禽类白血病的快速、准确检测提供一种新的选择。 材料与方法 病毒和标准质粒 本研究使用亚群禽白血病病毒原株,复制并分离病毒基因组,提取出病毒基因组RNA作为阳性对照质粒。同时设计一种包含EⅢ基因的标准质粒,用于建立标准曲线以评估SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR的灵敏度和准确性。 设计引物和探针 设计引物和探针是建立PCR检测方法非常重要的一步。本研究中,根据病毒基因组序列设计一对特异性引物来扩增病毒基因组RNA,同时设计一个SYBRGreenⅠ荧光探针用于检测PCR扩增产物。引物和探针的序列如下: 引物F:5'-GGCTTAAGAAAAGCCGGACA-3' R:5'-TTGTTAGTGTGGGCGGTTTC-3' 探针:5'-FAM-CGGTGAAGACGAAGGTGCGTTCCACTTG-TAMRA-3' SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR是一种快速、高效、灵敏的PCR技术,可同时检测扩增产物和荧光信号,从而实现多功能定量检测。在本研究中,以RocheLightCycler®480实时PCR仪为平台,实现SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR检测亚群禽白血病病毒。 PCR反应体系如下: 10μl2xSYBRGreenⅠ反应体系 0.2μl引物F(10μmol/L) 0.2μl引物R(10μmol/L) 2μl样品模板(100ng/μl) 7.6μl无菌水 PCR反应条件如下: 95℃5min 95℃10s,53℃10s,60℃40s,共40个循环 95℃10s,65℃60s,缓慢升高至95℃,恢复至65℃,变性1min,60℃10s 结果 验证PCR产品特异性。 本研究将PCR扩增产物分别进行Sanger测序和比较序列,结果表明,PCR扩增产物的序列与预期的病毒基因组序列完全一致,表明所建立的PCR检测方法具有较高的特异性。 评价SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR的灵敏度和稳定性。 采用阳性对照质粒和标准曲线评估方法的灵敏度和稳定性。结果表明,本方法的灵敏度可达到0.1pg的病毒RNA,稳定性好,可重复检测,而标准曲线的R²值则达到了0.996,显示出较好的线性。 讨论 本研究建立了一种基于SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR技术的亚群禽白血病病毒检测方法,并对其进行了评价。该方法具有高度的特异性和灵敏度,并且在所有反应中都能产生荧光信号,因此是一种快速、准确和可靠的检测方法。此外,该方法还可以进行多重检测(可检测多种不同病毒),以更好地满足实际检测需求。 结论 基于SYBRGreenⅠ荧光实时定量PCR技术,本研究建立了一种快速、准确、可靠的亚群禽白血病病毒检测方法,该方法具有较高的特异性和灵敏度,并且可以进行多重检测。这为进一步研究和防治亚群禽白血病病毒等禽类疾病提供了一种重要的工具。