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精准型胞嘧啶碱基编辑器的构建与应用的任务书 任务书 一、任务背景 胞嘧啶(Cytosine,C)是DNA和RNA的四种碱基之一,与DNA中的鸟嘌呤(Guanine,G)配对。现代基因编辑技术广泛使用CRISPR/Cas9系统进行基因切割,但由于胞嘧啶碱基的多种转化方式,CRISPR/Cas9系统的编辑效率较低且难以预测。因此,开发精准型胞嘧啶碱基编辑器具有重要的理论意义和应用价值。 二、任务目标 1.构建具有高编辑准确度和效率的胞嘧啶碱基编辑器 通过构建多种胞嘧啶碱基编辑器,对其进行筛选和优化,以实现高度精准的胞嘧啶碱基编辑。 2.优化胞嘧啶碱基编辑器的体外和体内效率,并对其进行应用 针对常见的细胞类型和动物模型验证胞嘧啶碱基编辑器的效率和精准度,并应用于特定基因修饰和治疗研究。 三、任务方案 1.构建胞嘧啶碱基编辑器 在核酸酶基础上构建DNA胞嘧啶碱基编辑器和RNA胞嘧啶碱基编辑器。 2.筛选优化胞嘧啶碱基编辑器 利用系统生物学和生物化学手段,对胞嘧啶碱基编辑器进行筛选和优化,以提高其编辑效率和准确度。 3.验证编辑器的效率和精准度 使用常见的细胞类型和动物模型验证构建的编辑器在体内和体外的编辑效率和精准度。 4.应用胞嘧啶碱基编辑器进行特定基因修饰和治疗研究 利用构建的胞嘧啶碱基编辑器进行特定基因的编辑和修饰,并探索其在基因治疗中的应用。 四、任务进度和完成时间 本项目计划时间为12个月,具体计划如下: 第1-2月:文献调研,学习和掌握CRISPR/Cas9、核酸酶等相关技术 第3-4月:构建DNA和RNA胞嘧啶碱基编辑器,进行初步筛选和优化 第5-6月:通过系统生物学和生物化学手段对编辑器进行优化和验证 第7-9月:利用细胞和动物模型进行实验验证,并进行效率和精准度的测量和分析 第10-12月:应用编辑器进行特定基因修饰和治疗研究,并撰写相关科技论文 五、任务需求 1.实验室基础设施和材料支持 2.相应的技术培训和支持 3.合格的实验人员和研究生支持 4.资金支持 六、参考文献 1.LiuY,ZhanY,ChenZ,HeA,LiJ,WuH.PreciseandefficientgenomeeditingbyCRISPR-Cas9inzebrafish.CellBiosci20177:16. 2.ZhangY,GeX,YangF,ZhangL,ZhengJ,TanX,NiK,MoX,YangY,LiD.Comparisonofnon-canonicalPAMsforCRISPR/Cas9-mediatedDNAeditinginrice.PlantBiotechnolJ201917:914-917. 3.LiaoHK,ChenYX,ChenTW,etal.ImprovedCRISPR/Cas9-InducedHomology-DirectedRepairinDrosophilaanditsApplicationtoGenomeEditing.G3(Bethesda)20177:861-868. 4.YuW,PanJ,ZhangJ,HuangX,ZengZ,LiangJ.VeryfastCRISPRondemand.ScienceAdvances20195:eaaw1043.