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Ⅱ型伪狂犬病毒感染细胞中lncRNA表达谱分析的开题报告
开题报告：Ⅱ型伪狂犬病毒感染细胞中lncRNA表达谱分析
一、研究背景
Ⅱ型伪狂犬病毒是一种重要的病毒性疾病，对家畜养殖业和经济发展产生了巨大的影响。随着人类对病毒学和分子生物学的研究的深入，越来越多的学者开始从病毒感染的分子水平上进行深入研究。长链非编码RNA（lncRNA）在细胞的生命过程中发挥着极为重要的作用，已成为生物医学研究中的热点。然而，在Ⅱ型伪狂犬病毒感染细胞中的lncRNA的作用仍然不明确，有待深入研究。
二、研究目的
本课题旨在分析Ⅱ型伪狂犬病毒感染细胞中的lncRNA表达水平变化和与其相关的调控网络，以探讨Ⅱ型伪狂犬病毒感染过程中lncRNA功能的作用机制和分子调控机理。
三、研究内容和方法
1.病毒感染模型的建立
本研究将通过细胞培养的方法，选用家畜等有重要经济价值的动物细胞，建立Ⅱ型伪狂犬病毒感染模型。研究过程中，选择不同的感染时间点，采取不同的病毒负载剂量，以获取更为准确的感染结果。
2.RNA提取和高通量测序
本研究将采用RNA提取试剂盒进行RNA的提取，并利用高通量测序技术，测定感染前后细胞中lncRNA的变化水平和表达谱，从而深入了解病毒感染引起的转录组变化。测序数据将通过生物信息学分析进行处理，参考已有的研究结果，确定差异表达的lncRNA，并进行后续的筛选和鉴定工作。
3.数据分析和功能研究
本研究将通过数据分析和生物信息学方法，精确地找出和鉴定差异表达的lncRNA，并注重其功能研究，分析其在生物学调节和疾病易感性方面的角色。同时，根据lncRNA的互作关系和开放数据库信息，构建lncRNA-miRNA-mRNA网络，探索lncRNA参与Ⅱ型伪狂犬病毒感染调控的分子机制。
四、研究意义
本研究将通过对病毒感染后细胞中的lncRNA表达谱进行深入的分析，探讨Ⅱ型伪狂犬病毒感染过程中lncRNA的功能和分子调控机理，对探索病毒感染过程中的分子调控机制，提高对Ⅱ型伪狂犬病毒的认识和预防控制具有重要意义，可为疾病的诊治提供新的思路和方法。
五、研究进度安排
1.第一周：文献调研、学术交流、实验室培训；
2.第二周：建立Ⅱ型伪狂犬病毒感染模型；
3.第三周：RNA提取和高通量测序；
4.第四周：生物信息学分析和差异表达的lncRNA鉴定及筛选；
5.第五周：lncRNA功能研究和互作网络构建；
6.第六至八周：实验、数据整理和统计分析、论文撰写与修改。
六、预期结果
1.更为准确的Ⅱ型伪狂犬病毒感染模型的建立；
2.精准鉴定差异表达的lncRNA，并说明其功能与分子调控机制；
3.构建lncRNA-miRNA-mRNA网络，阐明与Ⅱ型伪狂犬病毒的关联和调控机制；
4.发现新的病毒调控方式和新的细胞调控网络，对探究Ⅱ型伪狂犬病毒的发病机制和诊治研究具有重大意义。
七、参考文献
1.YaoRW,WangY,ChenLL.CellularfunctionsoflongnoncodingRNAs.NatureCellBiology,2019,21(5):542-551.
2.YangX,GaoM,LinZ,etal.LongnoncodingRNAexpressionprofilesinarabiesvirus-infectedDScelllinebyRNAsequencing.ArchivesofVirology,2018,163(6):1671-1680.
3.YangX,LinZ,GaoM,etal.Transcriptomicprofileofarabiesvirus-infectedcelllinerevealsapoptosisandautophagy-relatedgenesaswellaslongnoncodingRNAsaspotentialmodulators.VirologyJournal,2018,15(1):38.
4.WangCJ,ZhuXX,LiuKP,etal.Longnon-codingRNA-SUt-1promotesepithelial-mesenchymaltransitionandreducessurvivalinhepatocellularcarcinoma.CellDeath&Disease,2019,10(7):475.