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长链非编码RNA(lncRNA)在胃癌中的表达谱分析的开题报告 一、研究背景 胃癌是一种具有高度危害性的恶性肿瘤,其发病率和死亡率在世界范围内均位居前列,同时也是我国常见的恶性肿瘤之一。对胃癌发病机理、诊断和治疗进行深入的研究和探索,对于提高胃癌患者的生活质量和降低胃癌带来的危害具有重要意义。 近年来,越来越多的研究表明,长链非编码RNA(lncRNA)在肿瘤的发生、发展及转移中发挥着关键作用。lncRNA作为一种长度大于200nt的非编码RNA,常见于细胞质和细胞核中,可以通过多种方式参与转录调节、RNA改变、蛋白调控和信号传导等多个方面的生物学过程,影响肿瘤细胞增殖、分化、转移等多个方面的生物学过程。 二、研究目的 本研究旨在通过对胃癌患者组织与非胃癌患者组织的长链非编码RNA表达谱分析,探究lncRNA在胃癌发生、发展和转移中的作用机制,为胃癌的早期诊断和治疗提供一定的理论支持。 三、研究内容和方法 1.研究内容 (1)采集胃癌患者和非胃癌患者的组织,提取总RNA并进行长链非编码RNA的筛选和分离; (2)通过高通量测序技术,分析胃癌组织和非胃癌组织中lncRNA的表达谱变化,初步筛选出可能与胃癌发生、发展和转移相关的lncRNA; (3)利用RT-qPCR技术验证高通量测序筛选得出的lncRNA差异表达的结果,并分析其在胃癌中的表达水平及与肿瘤的关系; (4)对筛选得出的关键lncRNA进行功能注释和通路分析,探讨其在胃癌发生、发展及转移中的作用机制。 2.研究方法 (1)采用组织学方案制作胃癌组织、非癌组织组织芯片,包括恶性肿瘤和对应的非恶性组织样本; (2)采用RNeasyMiniKit(Qiagen)进行样品RNA的提取,用Agilent2100分析仪(AgilentTechnologies)检测RNA的完整性和浓度,并进行质量控制; (3)利用NEBNextUltraDirectionalRNALibraryPrepKitforIllumina进行RNA文库制备; (4)利用IlluminaHiSeq2000测序仪进行高通量测序,并分析差异表达基因(DEGs)和通路; (5)采用RT-qPCR技术验证高通量测序筛选得出的差异表达lncRNA表达水平,并对其功能进行生物学分析和验证。 四、研究意义和预期成果 本研究将通过对胃癌组织和非胃癌组织lncRNA的表达谱分析,探讨lncRNA在胃癌发生、发展及转移过程中的作用机制。研究预计将筛选出若干胃癌相关的lncRNA,并验证其在胃癌组织中的表达水平及与肿瘤的关系,探讨其在胃癌发生、发展和转移中的作用机制。并为深入探讨胃癌发生、发展与转移过程提供一定的理论支持,为胃癌的早期预防、诊断和治疗提供新的思路和方法。