狂犬病病毒感染细胞和小鼠的lncRNA和mRNA表达谱变化的开题报告.docx

狂犬病病毒感染细胞和小鼠的lncRNA和mRNA表达谱变化的开题报告
狂犬病是一种由病毒引起的传染病，主要通过受到狂犬病病毒感染的动物咬伤传播给人类。虽然现在有狂犬病疫苗和治疗方法，但全球仍有很多地方存在狂犬病传播的风险。因此，了解狂犬病引起的细胞和机体反应机制对于推动狂犬病病毒的预防和治疗具有重要的科学意义。
长链非编码RNA(lncRNA)是一种长度超过200nt且不编码蛋白质的RNA分子。近年来的研究表明，lncRNA在生物体内具有多种重要的生物学功能，包括基因调控、表观遗传调控等。通过研究狂犬病病毒感染细胞的lncRNA表达谱的变化，可以进一步认识到狂犬病的感染机制和导致病毒感染时细胞发生重要变化的分子机制。
本项目的研究目的是通过RNA测序技术分析病毒感染小鼠和细胞中mRNA和lncRNA的表达谱变化，并进一步对其中的差异表达基因（DEGs）进行生物信息学分析，以期发现狂犬病病毒感染的分子机制以及潜在的治疗靶点。
具体的研究设计为，在狂犬病病毒感染小鼠和细胞过程中，分别收集病毒感染前和感染24小时的小鼠和细胞，提取RNA并进行质量检测。然后，使用Illumina的RNA测序技术对RNA样品进行高通量测序，获得mRNA和lncRNA的表达谱数据，并利用基因差异表达分析软件包如DESeq2、edgeR进行数据分析。对于DEGs，进行基因本体注释和富集分析以揭示其生物功能和参与的代谢通路。此外，还将利用定量PCR技术，在整体水平确认RNA测序结果并对筛选的候选分子进行验证。
本项目预期的研究结果是发现许多狂犬病病毒感染细胞和小鼠后的mRNA和lncRNA编码基因或非编码基因的差异表达现象，同时通过生物信息学分析，确定差异表达的基因参与的关键通路和功能，探索这些基因作为潜在治疗靶点的可能性，并为进一步研究狂犬病病毒的感染及其机制提供参考。