APPPS1双转基因小鼠基因组DNA甲基化的检测与分析的中期报告.docx

APPPS1双转基因小鼠基因组DNA甲基化的检测与分析的中期报告
在对APPPS1双转基因小鼠进行基因组DNA甲基化的检测与分析中，我们已经完成了实验的中期阶段。下面是我们的中期报告：
1.实验流程
我们首先从APPPS1双转基因小鼠中提取了基因组DNA样本，随后使用甲基化特异性的限制酶MspI将DNA进行切割，并通过聚合酶链反应（PCR）扩增得到了MspI切割的DNA片段。得到的片段随后通过IlluminaHiSeq2000测序仪进行高通量测序，以获得基因组DNA甲基化水平的信息。
2.实验结果
我们已经获得了来自APPPS1双转基因小鼠基因组DNA的高通量测序数据，并对其进行分析，以确定甲基化水平。具体来说，我们通过测序数据对每个基因组位点的甲基化水平进行了计算，并将其相对于全基因组的平均甲基化水平进行了归一化处理。我们也在小鼠脑组织中进行了相似的分析，并比较了小鼠脑组织和APPPS1双转基因小鼠的基因组DNA甲基化水平。
我们的中期结果表明，与小鼠脑组织相比，APPPS1双转基因小鼠的基因组DNA甲基化水平明显降低，这表明该转基因小鼠在甲基化修饰方面存在差异。此外，我们鉴定了一些显著差异的甲基化位点，在这些位点周围的基因与转录因子会存在差异程度的表达。这些差异可能会导致细胞的表观遗传学变化，从而影响转基因小鼠的神经系统发育和功能。
3.下一步工作
在接下来的研究中，我们计划对甲基化水平差异显著的位点进行更深入的研究，并在此基础上探讨与转录因子和基因表达的关系，以更好地理解这些差异如何影响转基因小鼠的神经系统功能和疾病发展。