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第一章蛋白质结构与功能StructureandfunctionofProtein第一节蛋白质的分子组成 第二节蛋白质的分子结构 第三节蛋白质结构与功能的关系 第四节蛋白质的理化性质 第五节蛋白质分离与纯化的基本原理一、什么是蛋白质? 蛋白质(protein)是由许多氨基酸(aminoacid)通过肽键相连形成的高分子含氮化合物。 二、蛋白质的生物学重要性 1.蛋白质是构成生物体的基本成分占人体干重45%,细胞70% 2.蛋白质具有多样性的生物学功能 1)作为生物催化剂enzyme 2)代谢调节功能hormone 3)免疫保护功能Ab 4)物质的转运和储存功能binding-component 5)运动与支持 6)参与细胞间信息传递第一节蛋白质的分子组成二、组成蛋白质的基本单位——氨基酸(aminoacids) 1、氨基酸(AA)的通式 H RCCOOHα-氨基和α-羧基 NH2 2、特点: (1)20种基本氨基酸中,除脯氨酸为亚氨基酸外,其余19种均符合通式; (2)除甘氨酸的R基为H外,其余19种α-碳原子为不对称碳原子,有L、 D型之分,但组成人体蛋白质的氨基酸均为L型; (3)不同氨基酸的侧链基团不同。3、氨基酸的分类(根据侧链基团的结构和性质不同) (1)非极性疏水性AA:R为疏水基团,无极性。 Ala、Val、Leu、Ile、Met、Phe、Pro、Trp8种 (2)极性中性AA:R不带电荷,但显极性。 Gly、Ser、Thr、Tyr、Cys、Asn、Gln7种 (3)酸性AA:R可电离带负电荷,有极性。 Glu、Asp2种 (4)碱性AA:R可电离带正电荷,有极性。 Lys、Arg、His3种4.蛋白质中少见的氨基酸 羟脯氨酸、羟赖氨酸、四碘钾腺原氨酸(甲状腺素、T4) 胱氨酸-三、氨基酸的性质 1、两性电离性质等电点—— 使某种氨基酸所带正、负电荷数相等时溶液的PH值。2、紫外吸收特性 A280nm 3、茚三酮反应:可做氨基酸的定性、定量测定。第二节蛋白质的分子结构一、多肽的结构 1、肽键与肽 肽键(peptidebond):由一个AA的а-氨基与另一个氨酸的 а-羧基脱水缩合生成的化学键。肽peptide:AA通过肽键相连形成的化合物(二肽、三肽、寡肽和多肽)。 寡肽oligopeptide: 一般10肽以下 多肽polypeptide: 一般10肽以上 多肽链:由许多氨基酸借肽键相互连接而成的一种结构。 氨基酸残基:多肽链中的氨基酸,由于参与肽键的形成,已非原来完整的分子,称为——。 多肽链有两端:N末端、C末端天然存在的活性肽谷胱甘肽促甲状腺素释放因子 (TRH)蛋白质的分子结构蛋白质的一级结构 蛋白质的二级结构 蛋白质的三级结构高级结构 蛋白质的四级结构(空间构象)二、蛋白质分子的一级结构 1、一级结构(primarystructure):指蛋白质多肽链中氨基酸的组成及排列顺序。2、一级结构维系键:肽键和二硫键。 3、重要性:是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。三、蛋白质分子的空间构象(conformation) 蛋白质的构象指蛋白质分子中原子和基团在三维空间上的排列、分布及肽链的走向。 蛋白质分子的构象可分为二、三、四级结构。 维持蛋白质构象的化学键: 次级键(副键),由蛋白质分子的主链和侧链上的极性、非极性和离子基团等相互作用而形成的。 如:氢键、疏水键、离子键、范德华力、二硫键、配位键。氢键(HydrogenBond):一个已和负电性较强的原子共价结合的 氢原子与一个负电性较强的原子之间产生的静电引力。(一)蛋白质的二级结构(secondarystructure) 1.概念:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。 主链与侧链 由肽键和α-碳原子构成的多肽链骨架称为主链,伸展在外的R基团称为侧链。 2.主要形式:α-螺旋,β-折叠,β-转角,无规则卷曲。 主要维系键:氢键α-螺旋(α-helix)结构特点: ①右手螺旋:3.6AA/圈,螺距0.54nm。 ②氢键维系(形成于每个肽键的N-H和第四个肽键的羰基氧之间)。 ③侧链伸向螺旋外侧。 ④侧链基团影响螺旋的形成和稳定。 (带同种电荷,侧链大的R基或Pro存在均妨碍α-螺旋形成)β-折叠β-转角(β-turn)模体(motif)/超二级结构:蛋白质分子中α-螺旋、β-折叠、β-转角等组合在一起,彼此相互作用,形成有规则的二级结构组合体,作为三级结构的单元,其基本结合形式有:αα,βββ,βαβ。 结构域(structuraldomain):分子量大的蛋白质, 多肽链往往以超二级结构为单元组成两个或两个以上