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第一篇生物大分子的结构与功能PartI.Structure&functionofbiologicmacromolecules第一章蛋白质的结构与功能Chapter1.Structure&functionofprotein第一节.蛋白质的分子组成 Section1.Molecularcomposeofprotein根据侧链R在水溶液中的性质可分为: 1.非极性疏水性氨基酸:侧链为链烃 2.极性的中性氨基酸:侧链含有O、N或S原子组成的非电离极性基团,如羟基、巯基、酰胺基等 3.酸性氨基酸:Asp,Glu 4.碱性氨基酸:Lys,Arg,His 两种特殊氨基酸 A.脯氨酸(Pro):亚氨基酸 B.半胱氨酸(Cys):常以胱氨酸形式存在1.两性电离及等电点两性电离及等电点2.紫外吸收3.茚三酮反应肽键2.肽链(polypeptidechain) 由若干氨基酸通过肽键首尾相连而成的链状结构4.肽链的方向性 N-末端(N-terminal)和C-末端(C-terminal) 书写方向通常为:N-端在左,C-端在右1.根据组成成分第二节.蛋白质的分子结构 Section2.Structureofprotein1.概念 是指多肽链主链中各原子在局部的空间排布方式。这种局部肽段的排布通常是指周期性呈一定规则的空间结构。 2.组成——肽单元(peptideunit) 由于构成肽键的C-N键有部分双键性质,使肽键的四个原子和与之相连的两个α-碳原子都处于同一平面,称之为肽平面,或称肽单元。肽平面(peptideplane)3.二级结构的主要形式 ①.α-螺旋(α-helix) i.在二级结构中最常见、含量最丰富 ii.是局部肽段的盘绕呈右手螺旋状,侧链伸向四周的一种结构 iii.主要特征Cross-sectionalviewofanα-helix②.β-折叠(β-pleatedsheet) i.两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧向聚集在一起,呈折纸状,相邻肽链上的-NH-与C=O形成有规则的氢键,这样的结构称为β-折叠或β-片层。 ii.主要特征Modelofanantiparallelβ-pleatedsheet③.β-转角(β-turn) 是指多肽链中出现的一种180O回折 由第一个残基的C=O和第四个残基的-NH-形成的氢键来稳定其结构。4.二级结构的聚集——模序(motif) 由相邻的二至三个α-螺旋或β-折叠组成特定的组合体,发挥特殊的功能。如:钙结合蛋白的α螺旋-环-α螺旋,锌指结构等。5.影响二级结构形成的因素1.概念 是指一条多肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,亦即肽链上所有原子或基团的空间排布。 2.结构域与三级结构 结构域是指二级结构折叠比较紧密的区域,每个结构域都有自己独立的功能。 结构域通常是蛋白质的活性区域 3.三级结构的维系力——次级键 包括疏水作用、离子键(盐键)、氢键及VanderWaals力等ModelofmyoglobinathighresolutionDiagramofbindingdomainoffibronectinAlpha-carbondiagramofα-chymotrypsinModelofribonucleaseS1.概念 由两条或多条的肽链之间相互作用,彼此以非共价键相连而成的更复杂的空间排布。 2.组成单位:亚基(subunit)Summary第三节.蛋白质结构与功能的关系 Section3.Relationshipsbetweenstructureandfunctionsofprotein(二).一级结构与功能的关系镰刀形血红蛋白镰刀形红细胞贫血(sicklecellanemia)Differencesinaminoacidssequenceofinsulinfromhumanandanimals.二、蛋白质空间结构与功能的关系 (conformation&function)由4个亚基组成,分别为2个α-亚基和2个β-亚基 每个亚基的结构与Mb极相似 4个亚基共同围绕成紧密的球形,亚基之间以疏水作用和盐键维持稳定(二).血红蛋白的构象变化与结合氧(2).Hb的变构效应 未结合时处于紧张态(T态)第一个O2结合血红素后该亚基F肽段位移两个α-亚基之间的盐键断裂亚基间结合松弛第二、第三亚基更易结合O2三个亚基结合O2以后,第四亚基的血红素已几乎完全暴露,极易结合O2整个血红蛋白完全处于松弛态(R态)Summary(三)蛋白质构象改变与疾病第四节.蛋白质理化性质及其分离纯化 Section4.Physicochemicalproperties,separationandpurificationofprotein概念:是指某些理化因素使蛋白质分子的空间构象发生改变或破坏,导致其