结核分枝杆菌RPF样蛋白家族及其功能.pdf

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换反应，P印22p在IIl】刚A的释放过程中发挥作用，而是一种分子量为58∞的可以与RNA结合的新型核不控作用。盯B也能抑制57剪接位点，并且可能通过包的RNA酯交换反应，P印16p参与第二步的IⅢA酯交和评分，这些蛋白质包括SF2／ASF、SRp40、SRp55和sc35；进一步证实了与ESE序列相关的SR蛋白，在外显子的定位过程以及组成性剪接和选择性剪接过程中的重要作用。另一方面，人类的很多疾病都与SR蛋白非正常结合剪接位点有关。Stickeler等嘲对肿瘤的研究发现，在肿瘤形成之前，不同组织细胞中SR蛋白的表达类型各不相同，一般只表达1个家族中的1个亚型；随着肿瘤的发展，SR蛋白表达类型逐渐增多而各不相同。以至最后，恶性肿瘤中SR蛋白的表达类型变得十分复杂。另外，Li等嘲发现sR蛋白sF2，ASF在维持基因组的稳定方面也起作用。hnRNP形成因子多聚嘧啶区域结合蛋白(PTB)均一核糖核蛋白(hetribonucleoprotein，hnRNP)形成因子，它参与各种与RNA代谢相关的过程，也包括RNA的剪接【7]。P1m能与u2AF竞争结合多聚嘧啶区域，对37剪接位点起调裹外显子使其不被剪接体结合而使外显子被跳过。A1也是一类lln埘帅形成因子，最近有人对其进行晶体结构分析表明，它有两个独立折叠的与RNA结合的结构域，两者之间有一个连接体。两个RNA结合域(RNAdomain，RBD)对于U1部分区域具有很高的同源性，这可以解释两者之间的对于剪接位点结合的竞争关系。而在空间位置上，两个RBD呈反平行排列且彼此靠近，构成RNA结合平台，依靠两对Arg—Asp离子键来实现结构的相对稳定。这种反平行RNA结合平台的存在，使得RNA能够形成浓缩状态结合并集聚于平台上，从而有利于RNA分子的剪接和运输嘶】。RNA解旋酶类剪接因子最近几年，在酵母细胞中发现一类需要水解特定的核苷三磷酸进而发挥其功能的剪接因子。其中的代表是特定氨基酸位点是天冬氨酸一谷氨酸．随机氨基酸．组氨酸／天冬氨酸基序的核苷三磷酸酶(Asp—Glu—x-His／AspNTPase)。这类蛋白质因子具有“解旋酶”的结构域，有类似于核酸蛋白酶(RNPases)的功能，且极为保守。属DExH／D_boxNTPases蛋白家族的成员有Prp5、P印2、P印16、Prp22和Prp43等。通过实验，人们发现Prp5对于剪接复合体的聚合至关重要，Prp2催化复合体构象的改变以顺应第一步内含子的释放与Prp43的参与有关【8】。另外，P叩28和snRNP中的两个DExH／D出oxATPase，它们在Ul和U4snRNP从剪接复合体中释放过程中起作用【9】。对于剪接复合体来说，在完成一轮的剪接反应后解聚是很有必要的，因为这对于参与剪接的蛋白质因子的重新利用而促进下一轮的剪接反应很重要。在剪接催化过程中，u5snRNP扮演了重要角色，而Snull4和P叩8似乎是组成了U5《生命的化学》2007年27卷3期●MiniBrr2是U5snRNP的核心m】。CHEMISTRY2007，27(3)2．2gclhnRNPbinding2．3boxNTPase，DExH／D-boxReviews2220FLIFEeroeneousnuar·
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枝杆菌中的5个硝样基因和藤黄微球菌中的硝在进L．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．。．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．一RVl009L—————————————————————————————一RV2450cfH抛阳“fos括中5个何样基因信号肽切除位点预测【81(h仕p：，／www．cbs．dtu．d“services，s谵nalP／)短快速生长的藤黄微球菌和胞J已gm口f缸延滞期；缩对慢速生长的M幻v括，5种蛋白质的任一种在皮摩尔r_——，———————————————————————————————————————一RVl884c●小综述贝，该域常为串联重复；在酿酒酵母DNA结合蛋白YcR593中有一个拷贝。RpfC中LT—GEWL域为裂解性糖基转移酶(LT)和鹅蛋清溶菌酶(GEwL)域，二者都催化肽聚糖中的B．1，4一糖苷键，并在同一个胞壁酸残基的c6的羟基上形成一个新的糖苷键。3D结构预测，I印f保守的结构域和溶菌酶同源【6，71(图4)。在构建的模型中发现，催化位点及和底物结合位点的氨基酸残基保守。高度保守的催化位点G1u为Rpf活性所必需。但试验证明，Rpf没有溶菌酶活性。进化树(图4)可见，结核分化上非常接近。5个Rpf预测均可能为分泌蛋白隅1(表1)。RpfA的保守序列之后有一个富含脯氨酸和丙氨酸的序列；RpfB可能通过膜上脂蛋白N