生物信息学中的计算机技术应用.pdf

第15卷第10期微机发展Vol.15No.10
2005年10月MicrocomputerDevelopmentOct.2005

生物信息学中的计算机技术应用

1,2111
陈绮,周明全,耿国华,郑建国
(1.西北大学计算机系可视化研究所,陕西西安710069;
2.华南热带农业大学计算机系,海南儋州571737)

摘要:在跟踪了当前生物信息学发展的基础上,对生物信息学中的计算机技术应用进行分析,提炼出不同的计算机技术
在生物信息学科中的不同作用,以让更多的同行对这方面有所认识并在选题上有所借鉴。文中采用由点到面的方法,得出
了高性能的计算机体系和网络技术是生物信息学赖以生存和发展的生命线;数据库技术是生物信息学大厦的支柱;可视化
技术是生物信息学研究的重要手段;人工智能以及神经网络技术是生物信息学得以发展的保障等结论。
关键词:生物信息学;网络技术;可视化技术;数据库技术;人工智能及神经网络
中图分类号:Q811.4;TP39文献标识码:A文章编号:1005-3751(2005)10-0120-03

ApplicationofComputerTechnologyinBioinformatics

CHENQi1,2,ZHOUMing2quan1,GENGGuo2hua1,ZHENGJian2guo1
(1.InstituteofVisualizationTechnology,NorthwestUniversity,Xi.an710069,China;
2.ComputerDepartment,SouthChinaUniversityofTropicalAgriculture,Danzhou571737,China)

Abstract:Basedonlookingintothebioinformaticsnowadaysdevelopment,thispaperanalyzedtheapplicationofthecomputertechnology
andtheirdifferentfunctioninthenewsubject,somorecraftbrotherscanhaveanideainit,andcanuseforreferencewhentheychoose
researchfield.Thearticleadoptsthewayofinduction,educetheconclusionasbelow:thehigh-performancecomputerarchitectureand
thetechnologyofnetworkisthelifelineofthebioinformatics;thetechnologyofthedatabaseistheunderpinningoftheedificeofbioinfor2
matics;thetechnologyofvisualizationistheimportantmeansinthestudyofbioinformatics;theartificialintelligenceandtheneuralnet2
worktechnologyensurethedevelopmentofthebioinformatics.
Keywords:bioinformatics;networktechnology;visualizationtechnology;databasetechnology;artificialintelligenceandneuralnetwork

0引言组计划0(HumanGenomeProject,HGP),标志着人类历史
生物信息学(Bioinformatics)这一名词最早出现于上规模最大的科研工程的正式启动。至今世界上好多国
1991年的电子出版物中,是近年来新兴并正蓬勃发展的家都已相继成立了一大批具影响力的生物信息学中心。
一门新学科。关于生物信息学的定义,学者众说纷纭,但2001年2月人类基因组序列图谱公开发表,这意味着后
其要旨是:用数理和信息科学的观点、理论和方法去研究基因时代的到来。人类后基因组计划是由序列(结构)基
生命现象,组织和分析呈现指数增长的生物学数据的一门因组学向功能基因组学的转移,其目的是要对基因组生物
学科。首先是研究遗传物质的载体DNA及其编码的大学功能进行研究和应用。后基因组时代中,生命科学的中
分子蛋白质,以计算机为其主要工具,发展各种软件,对逐心任务是阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全部
日增长的浩如烟海的DNA和蛋白质的序列和结构进行蛋白质的表达规律和生物功能,生命科学的研究重心将从
收集、整理、储存、发布、提取、加工、分析和研究,目的在于基因组学(Genomics)转移到蛋白质