与番鸭繁殖性状相关的分子标记及应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN113430285A(43)申请公布日2021.09.24(21)申请号202110954743.2(22)申请日2021.08.19(71)申请人华南农业大学地址510610广东省广州市天河区五山(72)发明人聂庆华张思雨徐海平郭利金徐翌斌黄育林黎镇晖郑茗(74)专利代理机构北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙)11562代理人程小芳(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书5页序列表1页附图1页(54)发明名称与番鸭繁殖性状相关的分子标记及应用(57)摘要本发明公开了与番鸭繁殖性状相关的分子标记及应用，属于生物技术领域。本发明公开一种与番鸭繁殖性状相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQIDNO：1所示，且SEQIDNO：1所示序列的rs7092830位点处存在G>T突变，分为GG、TT、GT三种基因型。利用该分子标记检测番鸭的基因组DNA，经过试验发现，DRD2基因外显子序列的4个SNP位点，只有该基因7092830:G>T位点与番鸭的繁殖性状成显著相关。因此，本发明可以准确鉴定不同周龄的番鸭繁殖性状，为分子标记辅助选择育种提供了新的分子标记。CN113430285ACN113430285A权利要求书1/1页1.一种与番鸭繁殖性状相关的分子标记，其特征在于，其核苷酸序列如SEQIDNO：1所示，且SEQIDNO：1所示序列的rs7092830位点处存在G>T突变，分为GG、TT、GT三种基因型。2.一种用于扩增权利要求1所述的分子标记的引物对，其特征在于，包括如SEQIDNO：2所示序列的上游引物和SEQIDNO：3所示序列的下游引物。3.包含权利要求2所述的引物对的鉴别番鸭繁殖性状的试剂盒。4.一种鉴别番鸭繁殖性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)提取待测番鸭基因组DNA，利用权利要求2所述的引物对扩增，获得扩增产物；(2)对所述扩增产物测序，检测相应SNP位点的基因型。5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，扩增体系为：模板DNA2μL、金牌Mix26μLL、上游引物2μL、下游引物2μL。6.如权利要求4所述的方法，其特征在于，反应程序：98℃预变性3min；98℃变性10s，60℃退火10s，72℃延伸15s，15个循环，每个循环退火温度减1℃；98℃变性10s，50℃退火10s，72℃延伸15s，25个循环；72℃最终延伸3min；4℃保存。7.如权利要求4所述的方法，其特征在于，扩增产物测序时，若rs7092830位点为TT基因型，则番鸭35周龄产蛋量、38周龄产蛋量、300日龄产蛋量和45周龄产蛋量高且开产日龄小。8.如权利要求1所述的分子标记或者权利要求2所述的引物对或者权利要求3所述的试剂盒或者权利要求4所述的方法在番鸭育种中的应用。2CN113430285A说明书1/5页与番鸭繁殖性状相关的分子标记及应用技术领域[0001]本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种与番鸭繁殖性状相关的分子标记及应用。背景技术[0002]番鸭又名麝香鸭、瘤头鸭，原产于中、南美洲热带地区，现在我国江、浙、沪、皖、闽等地均有分布。产区群从在每年1～5月份孵化种蛋，按出壳时间先后，将雏鸭分为“头番”(2～3份出壳的雏苗)、“二番”(3～4月份的鸭苗)和“尾番”(5～6月份的鸭苗)。群从多选头、二番发育良好、生长快的鸭子留作种用。但是这种根据时间留种的方法，并不能准确判断繁殖性能的优劣。开产日龄、产蛋合格数和产蛋量等性状是鉴定番鸭的繁殖性能的关键指标。单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)是指基因组DNA序列由于插入、缺失、颠换和转换等单个碱基变化而引起的基因组DNA多态性，具有稳定遗传，易于检测等特性。SNP可用于分子标记辅助选择(MolecularMark‑assistSelection,MAS)，提高选种准确性和选育效果。[0003]多巴胺(Dopamine,DA)是一种神经递质，在大脑、肾脏、血管和胰腺等器官中发挥重要的作用。多巴胺受体2(DopamineReceptor2,DRD2)可通过的促卵泡激素(Follicle‑stimulatinghormone,FSH)和促黄体生成素(LuteinizingHormone,LH)协助生殖激素的分泌。DRD2基因的多个SNP位点与番鸭繁殖性能显著相关。因此，结合番鸭的繁殖性能指标提供一种新的SNP分子标记。发明内容[0004]本发明的目的是提供一种与番鸭繁殖性状相关的分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题，发现DRD2基因外显子区的SNP位点，并将其与番鸭的繁殖性状关联分析