一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114214431A(43)申请公布日2022.03.22(21)申请号202111573189.X(22)申请日2021.12.21(71)申请人华中农业大学地址430070湖北省武汉市洪山区狮子山街1号(72)发明人李小平李道洁刘鑫王晓彤张地(74)专利代理机构武汉宇晨专利事务所(普通合伙)42001代理人张红兵(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书7页序列表3页附图1页(54)发明名称一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用(57)摘要本发明属于动物分子标记筛选与应用领域，具体涉及一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用。所述分子标记是从MTHFR基因中克隆得到，该基因上的第一个分子标记MTHFR‑1的核苷酸序列如SEQIDNO：1所示，该序列第101位碱基处存在一个C/T的等位基因突变，引起所示序列的核苷酸产生多态性，CC和TC基因型个体的1胎总产仔数性状最优，TC基因型个体的2胎产活仔数性状最优。MTHFR基因上第二个分子标记MTHFR‑2的核苷酸序列如SEQIDNO：2所示，该序列第101位碱基处存在一个G/C的等位基因突变，引起所示序列核苷酸产生多态性，CG基因型个体的1胎总产仔数和2胎产活仔数性状为最优。CN114214431ACN114214431A权利要求书1/1页1.猪MTHFR基因上的两个SNP分子标记HFR‑1或/和HFR‑2在猪繁殖性状关联分析中的应用，其特征在于，所述猪品种为丹系大白猪，所述猪繁殖性状为1胎总产仔数和2胎产活仔数，所述分子标记的核苷酸序列如下所示：其中：HFR‑1分子标记：GCCGGGACCGGGAGGCGGAAGGTGGGACACGGTAGCCTCACGCGAAGGGTCTCAGGGCGCAGGGTCACTGGCCTCGGGCTCCTTCTCGTTGTGGGGGGGCRTGTTGAGAAGCTCAAATGTGTCCTCCACCACCTGCCAGAGGCAGTTGTCCAGCGGAAACTCGTTGTCCACCAGGTTGACCAGGAAGTAGTTGTCGTGGAT；上述序列中的101位的碱基R是C或T，其中TT基因型的1胎总产仔数显著低于CC基因型和TC基因型，2胎产活仔数显著低于TC基因型；HFR‑2分子标记：GATTATCCACGAATGGCCTCTCGTGCCAGGCTGGGAGCTCTCAGAGGGCAGGGGCCTGGCTCTGTCTGCGTGTCTGTCTGGCACAATGCCTGGATTGGCGRGGCGCTCCGTGATTGCCGGATGGTGGCATAAATGTGGCGCCCTCGGACCCGGTGACCCAGGCTGGCCCCTACCTTCACATCCACGATGTGATAATTCACT；上述序列中的101位的碱基R是G或C，其中CC基因型的1胎总产仔数和2胎产活仔数显著低于CG型；MTHFR‑1和MTHFR‑2的两个位点处于连锁不平衡状态，MTHFR‑1和MTHFR‑2基因型组合与总产仔数显著关联，其TC‑GG基因型是丹系大白猪母猪繁殖性状的有利基因型。2.扩增权利要求1所述的分子标记的引物组合在猪繁殖性状关联分析和辅助选择中的应用，其特征在于，所述猪品种为丹系大白猪，所述猪繁殖性状为1胎总产仔数和2胎产活仔数，所述引物组合的核苷酸序列如序列表SEQIDNO：3，SEQIDNO：4，SEQIDNO：5，SEQIDNO：,6，SEQIDNO：7和SEQIDNO：8所示。2CN114214431A说明书1/7页一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用技术领域[0001]本发明属于动物分子标记筛选和应用领域，具体涉及一种分子标记在猪繁殖性状关联分析中的应用。所述分子标记与猪总产仔数和产活仔数性状相关。本发明的分子标记从MTHFR基因中筛选得到。背景技术[0002]我国是一个养猪大国，随着消费水平的不断提高，我国居民对猪肉的需求量也在不断增加。与此同时，在养猪生产中，母猪的产仔数与养殖者的经济效益密切相关，且母猪的产仔数是衡量一头母猪繁殖性状的重要的指标之一(焦晓鹏2021)。因此，提高母猪的产仔数，可以减少母猪的饲养数量，提高生产水平，对猪场的生产和发展具有重要影响。由于母猪繁殖性状的遗传力较低，所以通过表型选择取得的遗传进展较小。通过分子标记辅助选择，可以显著提高育种效率。[0003]亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolatereductase，MTHFR)，在叶酸的代谢过程中发挥着重要功能，叶酸在母猪的妊娠早期非常重要，通过补充叶酸可以提高胚胎的存活率从而提高产仔数(Guay