与玉米南方锈病抗性相关的KASP标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114774573A(43)申请公布日2022.07.22(21)申请号202210415127.4(22)申请日2022.04.20(71)申请人北京市农林科学院地址100097北京市海淀区曙光花园中路9号(72)发明人王帅宋伟赵久然张如养王元东邢锦丰孙轩王继东刘倩(74)专利代理机构北京纪凯知识产权代理有限公司11245专利代理师李洋(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书2页说明书7页序列表1页附图2页(54)发明名称与玉米南方锈病抗性相关的KASP标记及其应用(57)摘要本发明公开了与玉米南方锈病抗性相关的KASP标记及其应用。本发明还公开了一种鉴定或辅助鉴定玉米南方锈病抗性的方法，所述方法是检测待测玉米第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸的基因型是GG、GA还是AA，根据所述待测玉米基因型确定南方锈病抗性：GG基因型和GA基因型的待测玉米表现为抗南方锈病；AA基因型的待测玉米表现为感南方锈病。通过实验证明：本发明提供的KASP标记可有效鉴定玉米南方锈病抗性，且鉴定方法操作简单，检测结果准确可靠，可用于玉米南方锈病抗性的鉴定及辅助选择育种，为选育南方锈病抗病玉米品种奠定理论基础。CN114774573ACN114774573A权利要求书1/2页1.一种鉴定或辅助鉴定玉米南方锈病抗性的方法，是检测待测玉米第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸的基因型是GG、GA还是AA，根据所述待测玉米基因型确定南方锈病抗性：GG基因型和GA基因型的待测玉米表现为或候选表现为抗南方锈病；AA基因型的待测玉米表现为或候选表现为感南方锈病；所述GG基因型为玉米基因组第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体；所述GA基因型为玉米基因组第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸为G和A的杂合体；所述AA基因型为玉米基因组第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸为A的纯合体。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述检测待测玉米第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸的基因型是GG、GA还是AA的方法包括如下步骤：以待测玉米的基因组DNA为模板，采用KASP引物组进行PCR扩增，将所得扩增产物进行荧光信号扫描，根据所述荧光信号判断待测玉米第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸的基因型是GG、GA还是AA。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于：所述KASP引物组由上游引物F1、上游引物F2及下游引物R组成；所述上游引物F1为序列1所示的单链DNA；所述上游引物F2为序列2所示的单链DNA；所述下游引物R为序列3所示的单链DNA。4.检测待测玉米第10染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在如下(a1)‑(a8)中任一种中的应用：(a1)鉴定或辅助鉴定待测玉米南方锈病抗性；(a2)制备鉴定或辅助鉴定待测玉米南方锈病抗性的产品；(a3)筛选或辅助筛选抗南方锈病玉米品种或感南方锈病玉米品种；(a4)制备筛选或辅助筛选抗南方锈病玉米品种或感南方锈病玉米品种的产品；(a5)玉米品种改良；(a6)制备玉米品种改良的产品；(a7)玉米育种；(a8)制备玉米育种的产品。5.如下(b1)‑(b3)中任一种产品：(b1)权利要求2或3中所述的KASP引物组；(b2)含有(b1)所述的KASP引物组的PCR试剂；(b3)含有(b1)所述的KASP引物组或(b2)所述的PCR试剂的试剂盒。6.权利要求5所述的产品在如下(c1)‑(c4)中任一种中的应用：(c1)鉴定或辅助鉴定待测玉米南方锈病抗性；(c2)筛选或辅助筛选抗南方锈病玉米品种或感南方锈病玉米品种；(c3)玉米品种改良；(c4)玉米育种。7.一种筛选或辅助筛选抗南方锈病玉米品种的方法，包括选择GG基因型或GA基因型的玉米品种的步骤；2CN114774573A权利要求书2/2页所述GG基因型为玉米基因组第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体；所述GA基因型为玉米基因组第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸为G和A的杂合体。8.一种筛选或辅助筛选感南方锈病玉米品种的方法，包括选择AA基因型的玉米品种的步骤；所述AA基因型为玉米基因组第10号染色体第1608911位脱氧核糖核苷酸为A的纯合体。9.一种玉米品种改良的方法，包括将按照权利要求7所述方法筛选得到的抗南方锈病玉米品种作为育种材料进行育种的步骤。10.权利要求7‑9任一所述方法在玉米育种中的应用。3CN114774573A说明书1/7页与玉米南方锈病抗性相关的KASP标记及其应用技术领域[