芒果细菌性角斑病抗性基因的KASP标记及应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115747368A(43)申请公布日2023.03.07(21)申请号202211286279.5(22)申请日2022.10.20(71)申请人中国热带农业科学院南亚热带作物研究所地址510000广东省湛江市麻章区湖秀路(72)发明人柳凤周思思卢乃会姚全胜詹儒林(74)专利代理机构北京维创华成知识产权代理事务所(普通合伙)16094专利代理师石佩(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书2页说明书10页序列表（电子公布）附图2页(54)发明名称芒果细菌性角斑病抗性基因的KASP标记及应用(57)摘要本发明提供了芒果细菌性角斑病抗性基因的KASP标记及其应用，涉及分子育种技术领域，该KASP标记位于芒果15号染色体第1,299,510位碱基，碱基多态性为G/A。本发明提供的KASP标记与芒果的细菌性角斑病抗性表现显著相关，与表型吻合度高、鉴定准确率高，可用于抗细菌性角斑病的芒果品种快速筛选和育种中。CN115747368ACN115747368A权利要求书1/2页1.一种芒果细菌性角斑病抗性基因的KASP标记，其特征在于，该KASP标记位于芒果15号染色体第1,299,510位碱基，碱基多态性为G/A。2.根据权利要求1所述的KASP标记，其特征在于，包括权利要求1所述的KASP标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1或SEQIDNO.2所示：SEQIDNO.1：CAGACACCACAACTTTCTCTACTTTGTCCCCCAGAATTTCCTTGATTGTCTTACACAGGTTCTCAAAGGACTTCTTCTTTTCCTCCTTTTTCTGCTTATCTTCCTCATCTTCATCAAGCTTTAGCCCTTCTTTGGTGGCCGAAACCAGCTTCTTACCATCATACTCCTTCAATTGACCAACAACATACTCATCAATGGCATCCACCATGTACAGCACTTCATATCCCTTCTTCTTGAGCTTCTCGAGGAAAGGAGAATTCTCAACAGCTTTCTTACTTTCACCAGTGATGTAGTAGATATCCTTTTGGCCCTCCTTCATCCTTGTAACATAGTCTTTC；其中的第184位为权利要求1所述的KASP标记；SEQIDNO.2：CAACAATCCTATCAGACACCACAACTTTCTCTATTTTGTCCCCCAGAATTTCCTTGATTGTCTTGCACAGGTTCTCAAAGGACTTCTTCTTTTCCTCCTTTTTCTGCTTATCTTCCTCATCTTCATCAAGCTTTAGCCCTTCTTTGGTGGCCGAAACCAGCTTCTTACCATCATACTCCTTCAATTGACCAACAGCATACTCATCAATGGCATCCACCATGTACAGCACTTCATATCCCTTCTTCTTGAGCTTCTCGAGGAAAGGAGAATTCTCAACAGCTTTCTTACTTTCACCAGTGATGTAGTAGATATCCTTTTGGCCCTCCTTCATCCTTGTAACATAGTCTTTCA；其中的第196位为权利要求1所述的KASP标记。3.权利要求1或2所述KASP标记在鉴定抗细菌性角斑病的芒果品种中的应用。4.一种抗细菌性角斑病的芒果品种鉴定方法，包括以下步骤：(1)提取待测样本DNA；(2)利用可包含权利要求1或2所述KASP标记的引物组，对待测样本DNA进行PCR扩增，得到扩增产物；所述引物组中包括第一正向引物、第二正向引物和通用反向引物，第一正向引物可扩增包括KASP标记为A时的序列、第二正向引物可扩张包括KASP标记为G时的序列；第一正向引物、第二正向引物均设置有可与荧光标记结合的特异性序列，第一正向引物、第二正向引物且可结合的荧光标记不同；(3)使扩增产物与荧光标记结合，检测荧光标记；若检测到可与第一正向引物结合的荧光，则待测样本的KASP标记多态性为A，鉴定为抗细菌性角斑病的芒果品种；若若检测到可与第二正向引物结合的荧光，则待测样本的KASP标记多态性为G，鉴定为感细菌性角斑病的芒果品种。5.根据权利要求4所述的鉴定方法，其特征在于，步骤(2)所述的引物组包括：第一正向引物：GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAGCTGCTACACACTCGGCCT，核酸序列如SEQIDNO.3所示；第二正向引物：GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAGCTGCTACACACTCGGCCC，核酸序列如SEQIDNO.4所示；通用反向引物：GCTGGGGAAAG