一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07-InDel及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115976266A(43)申请公布日2023.04.18(21)申请号202211727086.9(22)申请日2022.12.30(71)申请人山东省农业科学院地址250100山东省济南市工业北路23788号(72)发明人陈煜宋章强王芙蓉周娟杜召海潘奥赵程杰张军(74)专利代理机构北京高沃律师事务所11569专利代理师高辉(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书5页序列表（电子公布）附图2页(54)发明名称一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07-InDel及其应用(57)摘要本发明提供了一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel及其应用，属于陆地棉育种技术领域。本发明提供的与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。利用本发明分子标记可以在棉花生长早期快速、高效、准确鉴定棉铃大小，提高陆地棉大铃品种的选择效率。CN115976266ACN115976266A权利要求书1/1页1.一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel，其特征在于，所述InDel功能分子标记BW07‑InDel的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。2.一种用于检测权利要求1所述InDel功能分子标记BW07‑InDel的引物对，其特征在于，所述引物对包括核苷酸序列如SEQIDNO.2所示的正向引物和核苷酸序列如SEQIDNO.3所示的反向引物。3.一种用于检测陆地棉棉铃大小的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求2所述引物对。4.权利要求1所述InDel功能分子标记BW07‑InDel或权利要求2所述引物对或权利要求3所述试剂盒在检测陆地棉棉铃大小中的应用。5.权利要求1所述InDel功能分子标记BW07‑InDel或权利要求2所述引物对或权利要求3所述试剂盒在棉花高产品种选育中的应用。6.权利要求1所述InDel功能分子标记BW07‑InDel或权利要求2所述引物对或权利要求3所述试剂盒在分子聚合育种中的应用。7.权利要求1所述InDel功能分子标记BW07‑InDel或权利要求2所述引物对或权利要求3所述试剂盒在陆地棉基因图位克隆中的应用。8.一种检测陆地棉棉铃大小的方法，其特征在于，包括如下步骤：以待测棉花DNA为模板，用权利要求2所述引物对进行PCR扩增，得到扩增产物；根据扩增产物的长度判断待测棉花棉铃大小：当扩增产物的长度为1820bp时，则待测棉花的棉铃为小铃；当扩增产物的长度为975bp时，则待测棉花的棉铃为大铃。9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应体系为：ddH2O19μl，模板DNA2.0μl，2×PhantaFlashMasterMix25μl，10μM的正向引物2.0μl，10μM的反向引物2.0μl。10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应程序为98℃预热30s；98℃变性10s，57℃退火10s，72℃延伸10s，循环30次；72℃延伸1min，4℃保存。2CN115976266A说明书1/5页一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel及其应用技术领域[0001]本发明属于陆地棉育种技术领域，尤其涉及一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel及其应用。背景技术[0002]棉花是重要经济和油料作物，是纺织工业的主要原材料。棉花产量是由铃重(Bollweight,BW)、单株铃数(Numbersofperplant,NB)和衣分(Lintpercentage,LP)三因素构成。其中，铃重作为棉花产量性状的重要构成因子，是决定棉花产量的重要因素。铃重是用单铃内籽棉的重量表示，即由棉铃内的种子重量和棉纤维的重量相加而成，铃重性状的选择需要通过室内考种确定，具有一定的滞后性，影响田间育种选择效率。而棉铃大小一定程度上可以直观反映铃重大小，因此，育种工作者常把棉铃大小作为田间考察的重要指标。如何快速、高效、准确鉴定棉铃大小需要通过目标性状的精细定位，寻找到与之紧密连锁的分子标记。然而目前有关与棉花棉铃大小(铃重)紧密连锁的分子标记未见报道，且目标性状基因克隆研究的报道较少，不能满足现代快速的分子标记辅助选择育种和分子聚合育种。发明内容[0003]有鉴于此，本发明的目的在于提供一种与陆地棉棉铃大小紧密连锁的InDel功能分子标记BW07‑InDel，利用本发明分子标记可以在棉花生长早期快速、高效、准确鉴定棉铃大小，