一种影响杜洛克种猪肌内脂肪含量的分子标记及应用.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN108315433A(43)申请公布日2018.07.24(21)申请号201810183426.3(22)申请日2018.03.06(71)申请人华南农业大学地址510642广东省广州市天河区五山路483号(72)发明人杨杰吴珍芳庄站伟丁荣荣郑恩琴蔡更元(74)专利代理机构广东广信君达律师事务所44329代理人杨晓松(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书5页序列表1页附图2页(54)发明名称一种影响杜洛克种猪肌内脂肪含量的分子标记及应用(57)摘要本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，涉及一种与杜洛克猪肌内脂肪含量相关的SNP分子标记，该SNP标记的位点为国际猪参考基因组11.1版本7号染色体上第117427086个核苷酸位点，该位点的碱基是G或A。本发明通过优选该SNP的优势等位基因，能够逐代增加优势等位基因频率，提高猪肌内脂肪含量，加快猪遗传改良进展从而有效提高种猪育种的经济效益。CN108315433ACN108315433A权利要求书1/1页1.一种与猪肌内脂肪含量相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO：1所示，其序列中的M是G或A，导致猪肌内脂肪含量出现多态性。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的位点为国际猪参考基因组11.1版本7号染色体上第117427086个核苷酸位点，该位点的碱基是G或A。3.一种用于检测如权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列如SEQIDNO：2和SEQIDNO：3所示。4.如权利要求3所述的引物对在提高猪肌内脂肪含量中的应用。5.一种检测猪肌内脂肪的方法，其特征在于，检测猪SEQIDNO:1所示序列中，M标记的单核苷酸是G还是A。6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，采用权利要求3所述的引物对进行检测。7.一种提高猪肌内脂肪含量的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：检测猪的国际猪参考基因组11.1版本7号染色体上第117427086个核苷酸位点的基因型，选择第117427086个核苷酸位点的GG型个体作为种猪，或者检测猪SEQIDNO:1所示序列中，M标记的单核苷酸是G还是A，选择M为G的个体作为种猪。8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)提取待测猪的基因组DNA；(2)采用权利要求3所述的引物对，将所述待测猪的基因组DNA进行PCR扩增，以便获得PCR扩增产物；(3)对所述PCR扩增产物进行测序，以便获得测序结果；(4)基于所述测序结果，确定所述待测猪的如权利要求1或2所述的SNP分子标记的基因型，淘汰该位点的AA型和AG型个体，以逐代提高该位点的纯合基因型GG型的频率，从而提高后代的肌内脂肪含量。9.根据权利要求1-2、4-8任一所述的方法，其特征在于，所述种猪包括杜洛克及其合成系。2CN108315433A说明书1/5页一种影响杜洛克种猪肌内脂肪含量的分子标记及应用技术领域[0001]本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，涉及一种与杜洛克种猪肌内脂肪含量相关的SNP分子标记及其用途。背景技术[0002]随着人们生活水平的提高，猪肉的品质受到越来越多的关注。在影响猪肉品质的众多因素中，肌内脂肪(IntramuscularFat,IMF)作为一个重要的指标，影响着肉的嫩度、系水力、剪切力值、风味和多汁性。适量的肌内脂肪含量能使肉质嫩滑可口、味美多汁，因此，对影响猪肌内脂肪含量的因素的研究一直是育种工作者的重点。[0003]近百年来，以杜洛克为代表的瘦肉型种猪大多以提高瘦肉率和降低背膘厚为重要的育种目标。然而，背膘厚度与肌内脂肪含量呈遗传正相关，而瘦肉量与肌内脂肪含量呈遗传负相关，因此采用常规育种方法难以获得瘦肉率高、背膘厚低而肌内脂肪高的种猪新品系。而利用分子生物学的方法，通过先找到影响肌内脂肪含量的DNA分子标记，进而筛选优势等位基因用于育种，则有望改善瘦肉型种猪的肌内脂肪含量，从而提高猪肉品质。[0004]肌内脂肪含量是复杂的数量性状，由多基因控制。过去，人们通过候选基因法(Candidategeneapproach)和QTL定位(QTLMapping)进行QTL检测。候选基因法已鉴别到部分影响肉质性状的候选基因，如氟烷基因、酸肉基因以及PRKAG3基因等，但它们并不能直接影响猪肉的肌内脂肪含量。候选基因法虽然具有方法简单、操作方便等优点，但只能针对生物学功能已知的基因；而QTL定位方法所鉴定的候选位置基因的置信区域同样较大，这极大地限制了复杂性状分子标记在家畜遗传育种中的